Строение и функции белков 10 класс урок: План-конспект урока по биологии (10 класс) на тему: Урок по теме:»Белки»
Конспект урока на тему «Белки» (10 класс)
10 класс. Биология (ПРОФ)
Тема урока: «Биологические полимеры – белки». (2 часа)
Тип урока: комбинированный
Цель урока: сформировать понятие о белках, как о органических полимерах, раскрыть состав, структуру, свойства и функции белков; развивать умение работать с учебником, анализировать. Сравнивать, делать выводы; воспитывать культуру труда.
Оборудование: мм презентация
Ход урока
организационный момент
Актуализация знаний
Что относят к неорганическим и органическим веществам клетки?
Каково строение и свойства воды и минеральных солей?
Каковы функции воды и минеральных солей?
Приложение 1
Изучение нового материала
БЕЛКИ — основная составная часть любой живой клетки. На их долю приходится половина сухого вещества клетки (после удаления из нее волы).
Состав белков.
В состав белков кроме С H O N могут входить S P Fe. Белки- полимеры, мономерами которых являются аминокислоты. В образовании огромного многообразия белков участвуют всего 20 аминокислот. Все аминокислоты содержат карбоксильную группу –COOH- с кислотными свойствамии аминную группу –NH2 с основными свойствами, что обеспечивает их высокую реактивность. Отличаются аминокислоты только углеводородным радикалом. Соединяясь молекулы аминокислоты образуют пептидные связи между углеродом кислотной и азотом основной групп.
Структуры белков.
Молекулы белков имеют различные пространственные конфигурации, ив их строении различаютчетыре уровня структурной организации:
первичная структура белка – последовательность аминокислот в составе полипептидной цепи;
вторичная структура имеет вид спирали в результате образования водородных связей между –СО и -NH- разных аминокислотных остатков полипептидной цепи;
третичная структура— трехмерная пространственная упаковка полипептидной цепи. В результате образуется глобула;
четвертичная структура возникает в результате соединения нескольких макромолекул с третичной стуктурой.
Свойства белков.
При изменении температуры, облучении рентгеновскими лучами, обезвоживании, резком изменении рН среды белковая молекула разрушается. Этот процесс называется денатурацией. Процесс денатурации обратим, если не разрушена первичная структура белка. Процесс восстановления естественной структуры белка называется
ФУНКЦИИ БЕЛКОВ
Какие функции белков вы проходили на уроках биологии?
Функции белков в клетке чрезвычайно многообразны.
Одна из важнейших — строительная (структурная) функция: белки участвуют в образовании всех клеточных мембран и органоидов клетки, а также внеклеточных структур. Белки, выполняющие структурные функции, занимают по количеству первое место среди других белков тела человека. Среди них важнейшую роль играет коллаген в соединительной ткани, кератин в волосах, ногтях, коже, эластин в сосудистой стенке и др. Большое значение имеют комплексы белков с углеводами в формировании ряда секретов — мукоидов, муцина и т. д. В комплексе с липидами (в частности фосфолипидами) белки участвуют в образовании биомембран клеток.
Исключительно важное значение имеет каталитическая (ферментативная) роль белков. Всеферменты — вещества белковой природы, они ускоряют химические реакции, протекающие в клетке, в десятки и сотни тысяч раз. Многочисленные биохимические реакции в живых организмах протекают в мягких условиях, при температурах, близких к 40°С, и значениях рН, близких к нейтральным. В этих условиях скорость протекания большинства реакций ничтожно мала, поэтому для их приемлемого осуществления необходимы специальные биологические катализаторы — ферменты. Как правило, ферменты — это либо белки, либо комплексы белков с каким-либо кофактором — ионом металла или специальной органической молекулой. Многие белки ускоряют химические реакции в сотни раз.
Двигательная функция живых организмов обеспечивается специальными сократительными белками. Эти белки участвуют во всех видах движения, к которым способны клетки и организмы: образование псевдоподий, мерцание ресничек и биение жгутиков у простейших, сокращение мышц у многоклеточных животных, движение листьев у растений и др.
В акте мышечного сокращения и расслабления участвует множество белковых веществ. Однако главную роль в этих жизненно важных процессах играют актин и миозин — специфические белки мышечной ткани. Сократительная функция присуща не только мышечным белкам, но и белкам цитоскелета, что обеспечивает тончайшие процессы жизнедеятельности клеток (расхождение хромосом в процессе митоза).
Транспортная функция белков заключается в присоединении химических элементов (например, кислорода) или биологически активных веществ (гормонов) и переносе их к различным тканям и органам тела.
Дыхательная функция крови, в частности перенос кислорода, осуществляется молекулами гемоглобина — белка эритроцитов. В транспорте липидов принимают участие альбумины
сыворотки крови. Ряд других сывороточных белков образует комплексы с жирами, медью, железом, тироксином, витамином А и другими соединениями, обеспечивая их доставку в соответствующие органы-мишени.Защитная функция. При поступлении в организм чужеродных белков или микроорганизмов в белых кровяных тельцах — лейкоцитах — образуются особые белки — антитела. Они связывают и обезвреживают несвойственные организму вещества (антигены).
Высокая специфичность взаимодействия антител с антигенами (чужеродными веществами) по типу «белок — белок» способствует узнаванию и нейтрализации биологического действия антигенов. Защитная функция белков проявляется и в способности ряда белков крови к свертыванию. Свертывание белка плазмы кровифибриногена приводит к образованию сгустка крови, что предохраняет от потери крови при ранениях.
Гормональная функция. Обмен веществ в организме регулируется разнообразными механизмами. В этой регуляции важное место занимают гормоны, вырабатываемые в железах внутренней секреции. Ряд гормонов представлен белками или полипептидами, например гормоны гипофиза, поджелудочной железы и др.
Белки служат и одним из источников энергии в клетке, т. е. выполняют энергетическую функцию. При полном расщеплении 1 г белка выделяется 17,6 кДж энергии.
Закрепление
Что такое белки?
Перечислить виды пространственной конфигурации белков?
Какую роль играют водородные связи в строении белковых молекул?
Охарактеризуйте физические свойства белков.
Какие реакции характерны для белков?
Что такое денатурация белков?
Какие функции выполняют белки в организме?
Творческое задание (парная работа)
Составить синквейн по теме «Белки»
Белки.
2. Глобулярные, фибриллярные.
3. Защищают, регулируют, катализируют.
4. Мономерами являются аминокислоты.
5. Жизнь.
Приложение 2,3.
Рефлексия
Сегодня на уроке я…..
Домашнее задание
Пар. 3.2.1 Записи в тетр.
Приложение 1.
«Вода и минеральные вещества клетки»
Вещества плохо, или совсем не растворяющиеся в воде.
2. Вода, находящаяся в межклетных пространствах, сосудах, вакуолях, полостях организма.
3. Одно из самых распространённых веществ на нашей планете.
4. Раствор, содержащий смесь какой-либо слабой кислоты и её растворимой соли.
6. Поверхностное состояние воды, которое возникает благодаря образованию водородных связей между молекулами воды и молекулами других веществ.
7. Способность воды, поглощать тепловую энергию при минимальном повышении собственной температуры.
8. Остатки этой кислоты способствуют выведению из организма нерастворимых в воде веществ.
9. Вещества, хорошо растворимые в воде.
Приложение 2.
«Белки – органические полимеры. Строение белков».
1. Химическая связь, образующаяся в ходе реакции полимеризации.
2. Структура белковой молекулы, возникающая в результате соединения нескольких глобул в сложный комплекс.
3. Структура белка, имеющая вид клубка.
4. Структура белковой молекулы, представляющая линейную последовательность АК, в составе полипептидной цепи.
5. Белки, состоящие только из аминокислот (АК).
6. Структура белка, возникающая в результате образования водородных связей между СО– и NН–группами разных аминокислотных остатков полипептидной цепи.
7. Белки, содержащие небелковую часть.
8. Незаменимая аминокислота, которую человек получает с пищей в готовом виде.
9. Структура представляющая собой причудливую, но для каждого белка специфическую конфигурацию.
10. Утрата белковой молекулой природной структуры, под воздействием температуры, химических веществ, обезвоживания, облучения и других факторов.
11. Пространственные формы белковых молекул.
12. Белки, содержащие в себе углеводы, жиры, нуклеиновые кислоты … .
13. Белок, состоящий только из белковых молекул.
Приложение 3.
«Белки – органические полимеры. Функции белков».
1. Функция, при которой гемоглобин переносит кислород из лёгких к клеткам других тканей.
2. Гормон, регулирующий содержание глюкозы в крови.
3. Функция, при которой белковые молекулы ферментов способны ускорять течение биохимических реакций в клетке в сотни миллиардов раз.
4. Белок, предохраняющий организм от кровопотери.
5. Небелковое соединение в молекуле фермента.
6. Заболевание, возникающее при недостатке инсулина.
7. Белки, выделяемые организмом, являющиеся сильными ядами.
8. Функция, когда белок является основой всех биологических мембран органоидов клетки.
9. Функция белка, когда он может стать источником энергии в клетке.
10. Универсальные противовирусные белки.
11. Функция белка, предохраняющая организм от вторжения чужеродных организмов и от повреждений.
12. Функция белка, когда он регулирует различные физиологические процессы в организме.
13. Белки, способные подавлять действия ядов.
Урок биологии «Функции белков», 10 класс
Учитель Ефимова Г.В.
Цель урока: используя знания о строении и свойствах белков расширить представления о функциях белков через творческую и исследовательскую деятельность (Слайд №2).
Задачи (Слайд №3)
Образовательная:
Расширить знания о белках как природных полимерах, о многообразии их функций во взаимосвязи со строением и свойствами.
Развивающие:
1.Развивать мышление учащихся и умение устанавливать причинно-следственные связи на примере изучения свойств и функций белка.
2. Развивать практические умения постановки цитологических опытов при установлении роли белков ферментов.
3. Развивать умение делать выводы на основе практических работ, развивать умение самостоятельно получать информацию из дополнительных информационных источников (информационная компетентность).
4.Развивать умение структурировать материал.
5. Формировать способность рефлексировать свою деятельность.
Воспитательная:
1.Воспитывать умение работать в группе
2. Воспитывать аккуратность учащихся при выполнении и оформлении практических работ и записей в тетради.
Тип урока: комбинированный с использованием исследовательской деятельности.
Технологии: тестовая, ИКТ, проблемного обучения.
Методы: частично-поисковый, словесный, наглядный, исследовательский.
Оборудование: презентация «Функции белков», компьютер с мультимедийным проектором, лабораторное оборудование к исследованию по теме «Ферментативная функция белка»: чашки петри, пероксид водорода, пипетка, кусочки вареного и сырого мяса, вареного и сырого картофеля, речной песок.
Методическое обеспечение:
Раздаточный материал – текст «Белки» (Приложение №2), инструктивная карточка к лабораторной работе «Ферментативная функция белков» (Приложение №3), задание на установление соответствия между белками и их функциями (Приложение №4).
Презентация Microsoft PowerPoint «Функции белков» (Приложение №1) – (POWER POINT).
Актуальность использования средств ИКТ
Возможность представления в мультимедийной форме уникальных информационных материалов.
Ход урока:
1.Организационное начало урока (приветствие, проверка готовности к работе, психологический настрой на урок) (Слайд № 4).
Притча.
“Жил мудрец, который знал все. Один человек захотел доказать, что мудрец знает не все. Зажав в ладонях бабочку, он спросил: “Скажи, мудрец, какая бабочка у меня в руках: мертвая или живая?” А сам думает: “Скажет живая – я ее умерщвлю, скажет мертвая – выпущу”. Мудрец, подумав, ответил: “Все в твоих руках”.
В наших руках сегодня создать такую атмосферу на уроке, при которой все будут чувствовать себя комфортно.
Эпиграфом нашего урока будут слова А. Эйнштейна «Радость видеть и понимать есть величайший дар природы» (Слайд №5).
2.Мотивация
Задание: сделайте анализ круговой диаграммы (Слайд №6) и ответьте на вопросы:
1). Каков химический состав клетки?
2). Каких веществ органической природы в клетке больше?
3). О чем свидетельствует сходство химического состава клеток?
«Жизнь — это способ существования белковых тел» (Ф. Энгельс) (Слайд №7).
Ни одно вещество химики не изучали так долго, как белок прежде, чем удалось разгадать их строение. От первых шагов на пути познания состава белка до расшифровки структуры прошло более двухсот лет.
Любой биологический объект, начиная от вирусов и заканчивая человеком, состоит в основном из белков (в пересчете на сухое вещество),
поэтому очень важно знать строение, свойства и функции этих соединений.
3.Личностная значимость изучаемого материала.
В сутки человек должен обязательно употреблять 100 г белка, иначе разовьется белковое голодание.
(Слайд №8) Недостаток белков в питании вызывает у детей замедление роста и развития, а у взрослых — глубокие изменения в печени, нарушение деятельности желез внутренней секреции, изменение гормонального фона, ухудшение усвоения питательных веществ, проблемы с сердечной мышцей, ухудшение памяти и работоспособности.
В 70 годах отмечались смертельные случаи у людей, длительное время соблюдающих низкокалорийные диеты с выраженным недостатком белка. Происходило это из-за серьезных нарушений в деятельности сердечной мышцы. Дефицит белка уменьшает устойчивость организма к инфекциям. Кроме того, белковая недостаточность часто сопровождается авитаминозом В12, А, Д, К и так далее, что также влияет на состояние здоровья.
Вопрос к учащимся: «Какой личностный смысл для каждого из Вас имеют эти факты?»
Целеполагание
Задание:
Установите соответствие между белками и их функциями
(Слайд №9).
Белки: Функции
А. Кератин 1. Строительная
Б. Гемоглобин 2. Запасающая
В. Актин 3. Защитная
Г. Антитела 4. Двигательная
Д. Миозин 5. Транспортная
Е. Фибриноген 6. Ферментативная
Ж. Коллаген 7. Регуляторная
З. Альбумин
И.Каталаза
К. Пепсин
Л.Инсулин
Почему Вы не можете выполнить данное задание? (ответ: не хватает знаний)
Постановка проблемного вопроса. В состав клетки входят белки, жиры, углеводы, нуклеиновые кислоты, вода, минеральные вещества, но ни одно из веществ не выполняет столь специфичных функций, как белки. Справедливо ли это?
Учащиеся ставят цели и задачи работы на данном уроке.
5.Актуализация знаний.
Задания:
1.Работа со слайдами № 10, 11,12,13,14,15 и беседа по вопросам:
1). Что такое полимеры?
2) Используя схему, ответьте доказательно, к каким полимерам относятся белки?
3) Строение мономера белка.
4). Характеристика структурной организации белка.
2. Работа с текстом «Белки» (Слайд №16).
Вставьте в текст пропущенные термины и слова.
1). В состав белка входят следующие элементы___,___,____,___,____. 2).Белки – _______________,___________________ полимеры,
мономерами которых являются ____________________. 3).В состав природных белков входят ______ аминокислот, ___ из них незаменимые, т.е. синтезируются в организме и их поступление в организм не обязательно вместе с пищей. 4).Мономеры белка состоят из ___________,_________________.________________. 5).В состав всех мономеров белка входят___________,________________, а отличаются_______________.
6). Денатурация – процесс изменения нативной структуры белка.
6. Изучение нового материала
Свойства и функции белка определяются его структурой, строением и многообразием, поэтому даже малые его дефекты структуры имеют серьезные последствия.
Наследственное заболевание серповидно-клеточная анемия связано с тем, что при синтезе гемоглобина, состоящего приблизительно из 600 аминокислотных остатков, два из них заменяются на другие. Это приводит к нарушению функции гемоглобина: эритроциты больных приобретают серповидную форму и утрачивают способность к нормальному переносу кислорода (Слайд №17).
Это пример связи структуры и функции макромолекул.
Вам заранее было дано задание «Проанализировать информационные ресурсы сети-Интернет и составить несколько слайдов», а также сегодня мы проведем исследование. Данная деятельность позволит нам выяснить функции белков (Слайд 19-27)
Результатом данной работы будет таблица, которую по ходу работы будем заполнять.
Функции белков (Слайд №18).
Функция | Сущность | Пример |
Структурная | Образование мембраны клеток и органоидов и др. структур | Коллаген, кератин |
Регуляторная | Регулирование обмена веществ в организме | Некоторые гормоны – инсулин, глюкагон |
Защитная | 1. При попадании в организм чужеродных белков и микроорганизмов в лейкоцитах образуются защитные белки. 2. Защита от потери крови при ранении в результате свертывания | Антитела Фибриноген |
Транспортная | Присоединение и перенос химических элементов по организму | Гемоглобин |
Сократитель-ная | Осуществление всех типов движения | Актин, миозин |
Запасающая | Резерв для организма, плода | Яичный альбумин, казеин молока. |
Токсическая | Змеиный яд, дифтерийный токсин | |
Энергетичес-кая | Не основной, но источник энергии в клетке | Расщепление 1 г белка – 17 кДж |
Сигнальная | Узнавание молекул мембраной клетки | Гликопротеины |
Ферментативная или ката-литическая | Каталитическое ускорение биохимических реакций в клетке | Белки-ферменты (каталаза, пепсин, трипсин) |
Учащиеся представляют выполненную презентацию.
Давайте вспомним: «О чем в ядре клетки хранится наследственная информация» (представить логическую цепь: признак-вещество-реакция-белок-фермент). Павлов назвал ферменты «возбудителями жизни и первым актом жизненной деятельности».
Среди многочисленных функций белков особое место занимает ферментативная.
Наука о ферментах называется энзимологией, а ферменты – энзимами
Выражение И.П. Павлова «Не все белки – ферменты, но все ферменты белки» подчеркивают их химическую организацию.
Далее учитель объясняет строение и механизм действия фермента.
Чем же объясняется ускоряющее действие ферментов? (Слайд №28,29)
Каждый фермент имеет активный центр — определенная группа аминокислотных остатков. В активном центре происходит соединение фермента с субстратом (вещество, которое подлежит превращению) Форма активного центра и субстрата подходят друг другу как ключ к замку.
Процесс действия ферментов можно разделить на три стадии:
Фермент распознает субстрат и связывается с ним.
Образуется активный комплекс, состоящий из фермента и субстрата.
Отделение продукта в результате ферментативной реакции.
Свойства ферментов (анализ графиков) (Слайд 30-33)
Далее учащимся предлагается выполнить исследование.
Исследовательское задание
Лабораторная работа
«Ферментативное расщепление пероксида водорода в тканях организма»
Цель: сформировать знания о роли ферментов в клетках, закрепить умения проводить опыты и объяснять результаты работы.
Оборудование: свежий 3%-ный раствор пероксида водорода, штатив с пробирками, ткани растений (кусочки сырого и варёного картофеля) и животных (кусочки сырого и варёного мяса), пипетки, песок.
Ход работы:
1.Приготовьте четыре пробирки и поместите в первую пробирку — кусочек сырого картофеля, во вторую— кусочек варёного картофеля, в третью— кусочек сырого мяса, в четвёртую — кусочек варёного мяса. Капните в каждую из пробирок немного пероксида водорода. Пронаблюдайте, что будет происходить в каждой из пробирок.
2.Составьте таблицу, показывающую активность каждой ткани.
«Результаты исследования»
№ пробирки | Содержимое | Что делаю? | Что наблюдаю? |
№ 1 | |||
№ 2 | |||
№ 3 | |||
№ 4 | |||
№5 |
Ответьте на вопросы (устно):
В каких пробирках проявилась активность фермента? Объясните почему?
Как проявляется активность фермента в живых и мёртвых тканях? Объясните наблюдаемое явление.
Различается ли активность фермента в живых тканях растений и животных?
Как вы считаете, все ли живые организмы содержат фермент каталазу, обеспечивающую разложение пероксида водорода?
Ответ обоснуйте.
Сделайте вывод.
Группы учащихся отчитываются о выполнении задания.
7. Рефлексия. Учащиеся выполняют задание, делают вывод (Слайд № 34).
8.Домашнее задание (Слайд № 35): параграф, найти классификацию ферментов в Интернете.
Интернет-ресурсы:
www.biology.asvu.ru — все о биологии.
www.biodev.ru — все о биологии.
Строение белков.
Длинные белковые цепи построены всего из 20 различных типов аминокислот. Биологи называют их «волшебными» аминокислотами. Аминокислоты имеют общий план строения, но отличаются друг от друга по строению радикала. Соединяясь, молекулы аминокислот образуют так называемые пептидные связи. Реакция, на рисунке 13, называется реакцией полимеризации. В результате взаимодействия аминогруппы одной аминокислоты с карбоксильной группой другой аминокислоты выделяется молекула воды, а освобождающиеся электроны образуют ковалентную связь, которая получила название пептидной.
Две аминокислоты, соединившись, образуют дипептид, три – трипептид. Продолжите ряд, (4 — тетрапепсид, 5 — пентапептид, 6 — гекса… , а много — полипептид). Если вам в тексте учебника попадутся термины «полипептид», «полипептидная молекула», то вы уже будете знать, что речь идет о молекуле белка.информация учителя.
Белковые молекулы могут быть короткими и длинными, например:
- Инсулин — гормон поджелудочной железы, состоит из двух цепей: в одной 21, а в другой 30 аминокислотных остатков.
- Миоглобин — белок, мышечной ткани, состоит из 153 аминокислот.
- Коллаген- состоит из трех полипептидных цепей, каждая из которых содержит около 1000 аминокислотных остатков.
Помогите мне сформулировать определение понятия «белок».
Белок – это
— низкомолекулярное соединение или высокомолекулярное? (высокомолекулярное)
— можем мы назвать ее биополимером? (да)
— аргументируйте свою мысль (биополимеры – это крупные органические молекулы, состоящие из мономеров)
— что является мономером белковой молекулы? (аминокислоты)
— сколько видов аминокислот может входить в состав белковой молекулы? (20)
— белок относится к гомополимерам или гетерополимерам? Аргуменитруйте свою мысль. (к гетерополимерам, потому что в состав белков входят отличающиеся друг от друга мономеры – 20 аминокислот).
Белок это нерегулярный биополимер, мономерами которого являются аминокислоты.
По составу белки можно классифицировать:
- протеины – состоят только из белков
- протеиды – белок + небелковая часть:
а. гликопротеиды – аминокислоты + углеводы
б. липопротеиды – аминокислоты + жиры
в. нуклеопротеиды – аминокислоты + нуклеиновая кислота
г. металлопротеиды – аминокислоты + металлы (гемоглобин)
Уровни организации белковой молекулы (см. презентацию).
Молекулы белков имеют сложную пространственную структуру.
Линейная последовательность аминокислот в составе полипептидной цепи представляет первичную структуру белка. Она уникальна для любого белка и определяет его форму, свойства и функции.
Вторичная структура белков представляет собой спираль или гармошку. Витки спирали или ребра гармошки удерживаются водородными связями между группами — СООН и —NН2— . Хотя водородные связи малопрочные, но благодаря их значительному количеству в комплексе они обеспечивают довольно прочную структуру.
Третичная структура представляет собой причудливую, но для каждого белка специфическую конфигурацию, имеющую вид клубка (глобулу). Прочность третичной структуры обеспечивается ионными, водородными и дисульфидными (—S—S—) связями между остатками цистеина, а также гидрофобным взаимодействием.
Четвертичная структура характерна не для всех белков. Она возникает в результате соединения нескольких глобул в сложный комплекс. Например, гемоглобин крови человека представляет комплекс из четырех таких субъединиц, инсулин – из двух.
Денатурация и ренатурация белков.
Проблемные вопросы:
1. Почему врачи рекомендуют «сбивать» температуру больного, если она превышает 38 °С? (Из-за возможной тепловой денатурации белков).
2. Почему из сваренного яйца никогда не появится цыпленок? (Белки яйца необратимо теряют структуру из-за тепловой денатурации).
Денатурация — это утрата белковой молекулой своей структурной организации: четвертичной, третичной, вторичной, а при более жестких условиях — и первичной структуры (рис. 19). В результате денатурации белок теряет способность выполнять свою функцию. Причинами денатурации могут быть высокая температура, ультрафиолетовое излучение, действие сильных кислот и щелочей, тяжелых металлов и органических растворителей.
Денатурация может быть обратимой и необратимой, частичной и полной. Иногда, если воздействие денатурирующих факторов оказалось не слишком сильным и разрушение первичной структуры молекулы не произошло, при наступлении благоприятных условий денатурированный белок может вновь восстановить свою трехмерную форму. Этот процесс называется ренатурацией, и он убедительно доказывает зависимость третичной структуры белка от последовательности аминокислотных остатков, т. е. от его первичной структуры.
Вопросы к тексту:
- Что называется денатурацией? (утрата белковой молекулой своей структурной организации)
- Что может явиться причиной денатурации? (высокая температура, ультрафиолетовое излучение, действие сильных кислот и щелочей)
- В каком случае возможно восстановление структуры белковой молекулы? (если не произошло разрушение первичной структуры белка)
- Как называется этот процесс? (ренатурация)
- Какая структура белковой молекулы обеспечивает свойства белка и ее пространственную конфигурацию? (первичная)
Выполните опыты и объясните их результаты:
Белок яйца является типичным протеином. Выясните, что с ним произойдет, если на него подействовать водой, спиртом, ацетоном, кислотой, щелочью, растительным маслом, высокой температурой и т. д.
Нарисуйте таблицу. Какие функции белков вы знаете?
Функция | Сущность | Пример |
Структурная | Образование мембраны клеток и органоидов и др. структур | Коллаген кератин |
Регуляторная | Регулирование обмена веществ в организме | гормоны: инсулин глюкагон |
Защитная | -При попадании в организм чужеродных белков и микроорганизмов в лейкоцитах образуются защитные белки -защита от потери крови при ранении в результате свертывания | -антитела -фибриноген |
Транспортная | Присоединение и перенос химических элементов по организму | гемоглобин |
Сократительная | Осуществление всех типов движения | Актин, миозин |
Запасающая | Резерв для организма, плода | Яичный альбумин |
Токсическая | Змеиный яд | |
Энергетическая | Не основной, но источник энергии в клетке | Расщепление 1г |
Сигнальная | Узнавание молекул мембраной клетки | гликопротеины |
Ферментативная, каталитическая | Каталитическое ускорение биохимических реакций в клетке | Белки-ферменты Пепсин, трипсин |
Изучим подробнее каталитическую функцию белков.
Каталитическая функция — одна из важнейших функций белков. Все биохимические реакции протекают с огромной скоростью благодаря участию в них биокатализаторов — ферментов. Определение: ферменты — это белки, ускоряющие протекание реакций. Скорость ферментативных реакций в десятки тысяч (а иногда и в миллионы раз) выше скорости реакций, идущих с участием неорганических катализаторов. Например, пероксид водорода без катализаторов разлагается медленно: 2Н2О2 -> 2Н2О + О2. В присутствии солей железа (катализатора) эта реакция идет несколько быстрее. Фермент каталаза за 1 сек. расщепляет до 5 млн. молекул Н2О2.
Известно более 2000 ферментов. Несмотря на большое количество и разнообразие ферментов, все их по особенностям строения можно разделить на две группы: простые белки и сложные белки. У сложных ферментов помимо белковой части имеется добавочная группа- кофактор (например, у многих витаминов).
Активный центр фермента взаимодействует с молекулой субстрата с образованием фермент-субстратного комплекса. Затем фермент-субстратный комплекс распадается на фермент и продукт (продукты) реакции.
Согласно гипотезе, выдвинутой в 1890 г. Э. Фишером, субстрат подходит к ферменту, как ключ к замку, то есть пространственные конфигурации активного центра фермента и субстрата точно соответствуют друг другу. Субстрат сравнивается с «ключом», который подходит к «замку» — ферменту.
В 1959 году Д. Кошланд выдвинул гипотезу, по которой пространственное соответствие структуры субстрата и активного центра фермента создается лишь в момент их взаимодействия друг с другом. Эту гипотезу называют гипотезой «руки и перчатки» (гипотезой индуцированного соответствия).
Поскольку все ферменты являются белками, их активность наиболее высока при физиологически нормальных условиях: большинство ферментов наиболее активно работает только при определенной температуре. При повышении температуры до некоторого значения (в среднем до 50 °С) каталитическая активность растет (на каждые 10 °С скорость реакции повышается примерно в 2 раза). При температуре выше 50 °С белок подвергается денатурации и активность фермента падает.
Кроме того, для каждого фермента существует оптимальное значение рН, при котором он проявляет максимальную активность.
На скорость реакции влияет также концентрация субстрата и концентрация фермента. При увеличении количества субстрата скорость ферментативной реакции растет до тех пор, пока количество молекул субстрата не станет равным количеству молекул фермента. При дальнейшем; увеличении количества субстрата скорость увеличиваться не будет, так как происходит насыщение активных центров фермента. Увеличение концентрации фермента приводит к усилению каталитической активности, так как в единицу времени преобразованиям подвергается большее количество молекул субстрата.
Тема урока: Состав и строение белков. Функции белков – 10 класс
Уроки 5—6 (модульные).
Комплексная дидактическая цель: способствовать формированию умений самостоятельной работы с учебной литературой, поиска необходимой информации для выполнения заданий и овладение знаниями о химическом составе, уровнях организации, свойствах и функциях белков; развитие навыков проведения биологических опытов, наблюдений и формирование выводов на основе полученных результатов опыта.
Оборудование: таблица по общей биологии «Строение и уровни организации белка»; учебники А.А. Каменского, Ю.И. Полянского «Общая биология 10 — 11»; клубни картофеля, 3% раствор перекиси водорода, терки для картофеля, пробирки, пробиркодержатели, спиртовки, спички, вода.
Ход урока
I. Организационный момент
II. Самостоятельная работа с учебно-тематическими картами
П. Рефлексия в группах, обсуждение выполнения заданий учебных элементов.
IV. Выполнение лабораторной работы
V. Подведение итогов модульного урока, определение индивидуального домашнего задания
Строение и функции белков.
Номер учеб-ного элемента
Учебный материал с указанием заданий
Руководство по усвоению учебного материала
УЭ-0
Интегрирующая цель: в ходе работы с учебно- тематической картой вы должны выяснить особенности строения белковых молекул, их свойства и биологические функции.
Внимательно прочитайте цель урока.
УЭ — 1
Цель: выяснить особенности строения белковой молекулы.
I. Выполните следующие задания:
1. Какое из перечисленных ниже органических соединений является мономером белка:
глюкоза, глицерин, жирные кислоты, аминокислоты, моносахариды.
Работайте самостоятельно в рабочей тетради.
См.: учебник А.А. Каменского 10 кл., § 11, с.40;
Правильный ответ за задание № 1 – 3 балла,
2. Выполните формулу аминокислоты в общем виде. Укажите, какие функциональные группы входят в ее состав, каково значение радикала R ?
Работайте с партнером по парте. См.: учебник А.А. Каменского 10 кл, § 11, с. 40—41, рис. 12, 13;
Максимальное число баллов за задание № 2 – 1 балл.
3. Почему молекулы белка получили название «макромолекулы»?
См. текст учебника А.А. Каменского 10 кл., §11, с. 40; Правильный ответ № 3 — 2 б.
4. В организации белковых молекул участвует всего около 20 аминокислот, однако многообразие белков огромно. Чем это объясняется?
См.: уч. А.А. Каменского 10 кл., § 11, с. 40, рис. 12 Правильный ответ— З балла.
5. Найдите в предложенном полипептиде пептидные (амидные) связи, запишите формулу в тетрадь и покажите их:
Nh3 — CH – C – N – CH – C – N – CH – COOH
H O H CH O H CH
Ch4 Ch4 H S
См.: уч. А.А. Каменского 10 кл., § 11, с. 40 – 41;
Правильный ответ— 3 балла.
6. Рассмотрите классификацию аминокислот (рис. 12). Ответьте на вопросы:
1) На какие группы делятся аминокислоты?
2) Чем отличаются группы аминокислоты друг от друга?
3) Сколько полипептидных цепей может входить в состав белка? Приведите пример.
Заполните таблицу:
№Название группы аминокислот
Что входит в состав
Общая формула
См.: уч. А.А. Каменского 10 кл., § 11, с. 41-42, рис. 12 Правильный ответ— 8 баллов.
II. Оцените работу своего партнера.
Работайте в паре. Максимальное количество баллов по УЭ-1 —20 балл.
УЭ — 2
Цель: выяснить природу классификации белков по их составу.
Выполните следующие задания:
1. Белки делятся по сложности образования на группы:
Протеины — …
Протеиды — …
2. Какие белки и почему относят к простым или сложным?
Дайте определение: гликопротеиды, липопротеиды, нуклеопротеиды.
Работайте индивидуально.
См.: учебник А.А. Каменскою 10 кл., § 11, с. 42;
Правильный ответ оценивается в 3 балла.
УЭ — 3
Цель: изучить структурную организацию белковой молекулы и ее свойства.
Цель: структурную организацию белковой молекулы и ее свойства.
I. Выполните следующие задания:
1. Вставьте пропущенные слова:
«Аминокислотную последовательность в составе полипептидной цепочки относят к … структуре белка. В результате образования водородных связей между —СО— и —NН— группами разных аминокислотных
Работайте с партнером по парте. См.: учебник А.А. Каменского 10 кл, § 11, с. 41—42, рис. 14, 15;
Максимальное число баллов за задание 8 баллов.
остатков большинство белков имеют вид спирали — это … структура белка. Более плотная, трехмерная пространственная «упаковка» полипептида — … структура белка. Следующий уровень организации белковой молекулы — …, который воз —
никает в результате соединения нескольких макромолекул с третичной структурой в сложный комплекс».
2. Заполните таблицу:
№Уровень организации белковой молекулы
Какую форму имеет
Какие связи образуют её
3. Что такое конформация?
4. Молекулы белков обладают свойством денатурации. Что это такое? Почему в результате денатурации белки теряют свои функции? Схематично зарисуйте в тетради структуру белковой молекулы в активном состоянии и после денатурации. От чего зависит денатурация? Обратима ли она?
5. Какая структура белка определяет все особенности строения макромолекулы белка?
II. Обсудите и оцените свою работу.
Работайте в паре.
III. Поменяйтесь тетрадями с партнером по парте и оцените работу друг друга.
Максимальное количество баллов по УЭ-3 — 8 баллов.
УЭ — 4
Цель: изучить биологические функции белков.
I. Выполните следующие задания:
1. Белки выполняют в клетке много жизненных
функций. Запишите функции белков, характерные
для различных типов белковых молекул, заполните таблицу:
Типы белковФункции
Примеры
1. Структурные.
2. Ферменты.
3. Гормоны.
4.Сократительные
5. Транспортные.
6. Защитные.
7. Запасные.
Работайте индивидуально
Прочитайте текст учебника
А.А. Каменского 10 кл., § 11,
с. 43-46; дополнительный материал: учебник Ю.И. Полян
ского, §39, с. 154—155.
Правильный ответ— I4 баллов.
2. В каждой клетке содержатся тысячи ферментов. Что они собой представляют? Какова их роль в клетке? Почему при разрушении структуры ферментов жизнедеятельность клетки прекращается?
Работайте индивидуально.
См. текст учебника А.А. Каменского, §11, с. 44, рис. 16, с. 45; дополнительный материал: учебник Ю.И. Полянского, §39, с. 154 — 155.
Правильный ответ—3 балла.
3. Используя рисунок, объясните механизм взаимодействия фермента и субстрата.
См.: учебн. А.А. Каменского, § 1, с. 45;
Правильный ответ—6 б.
II. Выполните лабораторную работу «Расщепление пероксида
Урок биологии по теме «Функции белков». 10-й класс
Цель урока: используя знания о строении и свойствах белков расширить представления о функциях белков через творческую и исследовательскую деятельность (Приложение 1. Слайд №2).
Задачи (Слайд №3)
Образовательные:
Расширить знания о белках как природных полимерах, о многообразии их функций во взаимосвязи со строением и свойствами.
Развивающие:
1. Развивать мышление учащихся и умение
устанавливать причинно-следственные связи на
примере изучения свойств и функций белка.
2. Развивать практические умения постановки
цитологических опытов при установлении роли
белков ферментов.
3. Развивать умение делать выводы на основе
практических работ, развивать умение
самостоятельно получать информацию из
дополнительных информационных источников
(информационная компетентность).
4. Развивать умение структурировать материал.
5. Формировать способность анализировать свою
деятельность.
Воспитательные:
1. Воспитывать умение работать в группе
2. Воспитывать аккуратность учащихся при
выполнении и оформлении практических работ и
записей в тетради.
Тип урока: комбинированный с использованием исследовательской деятельности.
Технологии: тестовая, ИКТ, проблемного обучения.
Методы: частично-поисковый, словесный, наглядный, исследовательский.
Оборудование: презентация «Функции белков», компьютер с мультимедийным проектором, лабораторное оборудование к исследованию по теме «Ферментативная функция белка»: чашки петри, пероксид водорода, пипетка, кусочки вареного и сырого мяса, вареного и сырого картофеля, речной песок.
Методическое обеспечение:
- Раздаточный материал – текст «Белки» (Приложение 2), инструктивная карточка к лабораторной работе «Ферментативная функция белков» (Приложение 3), задание на установление соответствия между белками и их функциями (Приложение 4). Презентация Microsoft PowerPoint «Функции белков» (Приложение 1) – (POWER POINT).
- Актуальность использования средств ИКТ
- Возможность представления в мультимедийной форме уникальных информационных материалов (Приложение 5).
ХОД УРОКА
1. Организационное начало урока (приветствие, проверка готовности к работе, психологический настрой на урок) (Слайд № 4).
Притча
“Жил мудрец, который знал все. Один человек
захотел доказать, что мудрец знает не все. Зажав в
ладонях бабочку, он спросил: “Скажи, мудрец,
какая бабочка у меня в руках: мертвая или живая?”
А сам думает: “Скажет живая – я ее умерщвлю,
скажет мертвая – выпущу”. Мудрец, подумав,
ответил: “Все в твоих руках”.
В наших руках сегодня создать такую атмосферу на
уроке, при которой все будут чувствовать себя
комфортно.
Эпиграфом нашего урока будут слова А. Эйнштейна
«Радость видеть и понимать есть величайший дар
природы» (Слайд №5).
2. Мотивация
Задание: сделайте анализ круговой диаграммы (Слайд №6) и ответьте на вопросы:
1) Каков химический состав клетки?
2) Каких веществ органической природы в клетке
больше?
3) О чем свидетельствует сходство химического
состава клеток?
«Жизнь – это способ существования белковых
тел» (Ф. Энгельс) (Слайд №7).
Ни одно вещество химики не изучали так долго, как
белок прежде, чем удалось разгадать их
строение. От первых шагов на пути познания
состава белка до расшифровки структуры прошло
более двухсот лет.
Любой биологический объект, начиная от вирусов и
заканчивая человеком, состоит в основном из
белков (в пересчете на сухое вещество),
поэтому очень важно знать строение, свойства и
функции этих соединений.
3. Личностная значимость изучаемого материала
В сутки человек должен обязательно употреблять
100 г белка, иначе разовьется белковое голодание.
(Слайд №8) Недостаток белков в питании
вызывает у детей замедление роста и развития, а у
взрослых – глубокие изменения в печени,
нарушение деятельности желез внутренней
секреции, изменение гормонального фона,
ухудшение усвоения питательных веществ,
проблемы с сердечной мышцей, ухудшение памяти и
работоспособности.
В 70-х годах отмечались смертельные случаи у
людей, длительное время соблюдающих
низкокалорийные диеты с выраженным недостатком
белка. Происходило это из-за серьезных нарушений
в деятельности сердечной мышцы. Дефицит белка
уменьшает устойчивость организма к
инфекциям. Кроме того, белковая
недостаточность часто сопровождается
авитаминозом В12, А, Д, К и так далее, что также
влияет на состояние здоровья.
Вопрос к учащимся: «Какой личностный смысл для каждого из Вас имеют эти факты?»
4. Целеполагание
Задание: Установите соответствие между белками и их функциями (Приложение 4, Слайд №9).
Белки: Функции
А. Кератин 1. Строительная
Б. Гемоглобин 2. Запасающая
В. Актин 3. Защитная
Г. Антитела 4. Двигательная
Д. Миозин 5. Транспортная
Е. Фибриноген 6. Ферментативная
Ж. Коллаген 7. Регуляторная
З. Альбумин
И. Каталаза
К. Пепсин
Л. Инсулин
1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 |
Почему Вы не можете выполнить данное задание? (ответ: не хватает знаний)
Постановка проблемного вопроса. В
состав клетки входят белки, жиры, углеводы,
нуклеиновые кислоты, вода, минеральные вещества,
но ни одно из веществ не выполняет столь
специфичных функций, как белки. Справедливо ли
это?
Учащиеся ставят цели и задачи работы на
данном уроке.
5. Актуализация знаний
Задания:
1. Работа со слайдами № 10-15 и беседа по вопросам:
1) Что такое полимеры?
2) Используя схему, ответьте доказательно, к каким
полимерам относятся белки?
3) Строение мономера белка.
4) Характеристика структурной организации белка.
2. Работа с текстом «Белки» (Слайд №16).
Вставьте в текст пропущенные термины и слова.
1) В состав белка входят следующие
элементы___,___,____,___,____. 2) Белки –
_______________,___________________ полимеры,
мономерами которых являются ____________________. 3) В
состав природных белков входят ______ аминокислот,
___ из них незаменимые, т.е. синтезируются в
организме и их поступление в организм не
обязательно вместе с пищей. 4) Мономеры белка
состоят из ___________,_________________.________________. 5) В состав
всех мономеров белка входят___________,________________, а
отличаются_______________. 6) Денатурация – процесс
изменения нативной структуры белка.
6. Изучение нового материала
Свойства и функции белка определяются его
структурой, строением и многообразием, поэтому
даже малые его дефекты структуры имеют серьезные
последствия.
Наследственное заболевание
серповидно-клеточная анемия связано с тем, что
при синтезе гемоглобина, состоящего
приблизительно из 600 аминокислотных остатков,
два из них меняются на другие. Это приводит к
нарушению функции гемоглобина: эритроциты
больных приобретают серповидную форму и
утрачивают способность к нормальному переносу
кислорода (Слайд №17).
Это пример связи структуры и функции
макромолекул.
Работа со слайдом № 18
Результатом данной работы будет таблица, которую по ходу работы будем заполнять.
Функции белков
Функция |
Сущность |
Пример |
Структурная | Образование мембраны клеток и органоидов и др. структур | Коллаген, кератин |
Регуляторная | Регулирование обмена веществ в организме | Некоторые гормоны – инсулин, глюкагон |
Защитная | 1. При попадании в организм чужеродных
белков и микроорганизмов в лейкоцитах
образуются защитные белки. 2. Защита от потери крови при ранении в результате свертывания |
Антитела Фибриноген |
Транспортная | Присоединение и перенос химических элементов по организму | Гемоглобин |
Сократительная | Осуществление всех типов движения | Актин, миозин |
Запасающая | Резерв для организма, плода | Яичный альбумин, казеин молока. |
Токсическая | Змеиный яд, дифтерийный токсин | |
Энергетическая | Не основной, но источник энергии в клетке | Расщепление 1 г белка – 17 кДж |
Сигнальная | Узнавание молекул мембраной клетки | Гликопротеины |
Ферментативная или каталитическая | Каталитическое ускорение биохимических реакций в клетке | Белки-ферменты (каталаза, пепсин, трипсин) |
Давайте вспомним: «О чем в ядре клетки хранится
наследственная информация» (представить
логическую цепь: признак – вещество – реакция –
белок – фермент). Павлов назвал ферменты
«возбудителями жизни и первым актом жизненной
деятельности».
Среди многочисленных функций белков особое
место занимает ферментативная.
Наука о ферментах называется энзимологией, а
ферменты – энзимами.
Выражение И.П. Павлова «Не все белки –
ферменты, но все ферменты белки» подчеркивают их
химическую организацию.
Далее учитель объясняет строение и механизм
действия фермента.
Чем же объясняется ускоряющее действие ферментов?
(Слайд 19) Каждый фермент имеет активный центр – определенная группа аминокислотных остатков. В активном центре происходит соединение фермента с субстратом (вещество, которое подлежит превращению) Форма активного центра и субстрата подходят друг другу как ключ к замку.
Процесс действия ферментов можно разделить на три стадии:
- Фермент распознает субстрат и связывается с ним.
- Образуется активный комплекс, состоящий из фермента и субстрата.
- Отделение продукта в результате ферментативной реакции.
Свойства ферментов (анализ графиков) (Слайды 20-23)
Далее учащимся предлагается выполнить исследование.
Исследовательское задание (Работа по группам):
Лабораторная работа «Ферментативное расщепление пероксида водорода в тканях организма» (Приложение 3)
Цель: сформировать знания о роли ферментов в клетках, закрепить умения проводить опыты и объяснять результаты работы.
Оборудование: свежий 3%-ный раствор пероксида водорода, штатив с пробирками, ткани растений (кусочки сырого и варёного картофеля) и животных (кусочки сырого и варёного мяса), пипетки, песок.
Ход работы:
1. Приготовьте четыре пробирки и поместите в первую пробирку — кусочек сырого картофеля, во вторую — кусочек варёного картофеля, в третью — кусочек сырого мяса, в четвёртую — кусочек варёного мяса. Капните в каждую из пробирок немного пероксида водорода. Пронаблюдайте, что будет происходить в каждой из пробирок.
2. Составьте таблицу, показывающую активность каждой ткани.
«Результаты исследования»
№ пробирки | Содержимое | Что делаю? | Что наблюдаю? |
№ 1 | |||
№ 2 | |||
№ 3 | |||
№ 4 |
Ответьте на вопросы (устно):
— В каких пробирках проявилась активность
фермента? Объясните почему?
— Как проявляется активность фермента в живых и
мёртвых тканях? Объясните наблюдаемое явление.
— Различается ли активность фермента в живых
тканях растений и животных?
— Как вы считаете, все ли живые организмы
содержат фермент каталазу, обеспечивающую
разложение пероксида водорода?
— Ответ обоснуйте.
— Сделайте вывод.
Группы учащихся отчитываются о выполнении
задания.
7. Рефлексия. Учащиеся выполняют задание, делают вывод (Слайд № 24).
8. Домашнее задание (Слайд № 25):
1. Задание для всех: глава 3.2.1., таблица «Функции
белков»,
2. Задание для проявляющих интерес к предмету:
найти классификацию ферментов в Интернете.
Интернет-ресурсы:
www.biology.asvu.ru — все о
биологии.
www.biodev.ru — все о биологии.
КОНСПЕКТ УРОКА НА ТЕМУ
«ФУНКЦИИ БЕЛКОВ. СВОЙСТВА ФЕРМЕНТОВ».
Лабораторная работа «Изучение свойств ферментов»
ЦЕЛЬ: дать представление об основных функциях белков – ферментативной;
рассказать о ферментах, их основных свойствах (денатурация, ренатурация, деструкция) и принципе действия ферментов.
ТЕРМИНЫ: каталаза, уреаза, кофермент (активный центр), фермент – субстратный комплекс.
ОБОРУДОВАНИЕ: таблицы, схемы, рисунки, перекись водорода, пробирки, штативы, термо-метр, часы, стеклянная палочка, варенное мясо картофель, сырое мясо и картофель, горсть проросшего гороха, теплая вода (t 40 ) на бане.
КОНЦЕПЦИЯ УРОКА: Изучение свойств белков и функций ферментов, опираясь на знания о третичной структуре белков, показать принцип действия ферментов; наличие у них активного центра, способности образовывать фермент – субстратный комплекс и снижать энергию начала реакции,.
Исходя из этого, вывести другие свойства ферментов. Подвести итог, что ферменты – биологические катализаторы, ускоряющие реакции в десятки раз. На лабораторной работе показать учащимся свойства ферментов.
СТРУКТУРА УРОКА.
1. Организационный момент …………………………………………… 2 мин.
2. Актуализация опорных знаний………………………………………. 7 мин
3. Изучение нового материала………………………………………….. 15 мин
4. Выполнение лабораторной работы …………………………………. 10мин
5. Закрепление…………………………………………………………… 7 мин
6.Домашнее задание …………………………………………………….. 2мин
7.Итог урока Формулировка выводов …………………………. 2мин
СОДЕРЖАНИЕ И ХОД УРОКА.
Актуализация опорных знаний.
Устно.
Дайте определение белкам как непериодическим полимерам. Белки – важнейшая часть ЖО.
У доски.
- Записать строение структурной единицы белков – аминокислоты, отношение их к воде, доказать их амфотерные свойства.
- Записать пептидную связь, объяснить механизм ее образования.
- Записать классификацию радикалов аминокислот белков.
Работа с тетрадью.
- Тестирование по теме «Белки». Обменятся тетрадями, проставить оценки. Вводное
Обменятся тетрадями и подвести итог тестированию: 14 – 12; 13 – 11; 12 -10; 10, 11 -9; 9,8 -8, 7-7. 6-6 и т.д. Выставить оценки в журнал по домашнему заданию.(на перерыве)
Ответы:В1:1б; 2г; 3б;4б,в; 5б,в,г; 6а,б,в,г; 7а; 8б; 9в; 10г,з,и,к,л,м,о,с;
Ответы.В2;1в; 2б; 3а; 4б,в; 5б,в,г; 6б; 7б; 8б; 9в; 10г,з,и,к,л,м,о,с;
ТЕСТ 1. Тема: «БЕЛКИ». В I
- Белки полимеры: а) периодичные; б) не периодичные.
- Молекула белков образует структур: а) 1; б) 2; в) 3; г) 4; д) 5; е) 6; ж) 7; з) 8.
- Первичная структура белка образована типами химических связей: а) ионными;
б) ковалентными; в) водородными; г) гидрофобными.
- Вторичная структура белка образована типами химических связей: а) ионными;
б) ковалентными; в) водородными; г) гидрофобными.
- Третичная структура белка образована типами химических связей: а) ионными;
б) ковалентными; в) водородными; г) гидрофобными.
- Четвертичная структура белка образована типами химических связей: а) ионными;
б) ковалентными; в) водородными; г) гидрофобными.
7. Первичная структура белка имеет вид: а) нити; б) спирали; в) глобулы.
8. Вторичная структура белка имеет вид: а) нити; б) спирали; в) глобулы.
9. Третичная структура белка имеет вид: а) нити; б) спирали; в) глобулы.
10. К незаменимым аминокислотам относятся: а) лизин; б) аланин; в) тирозин; г) триптофан; д) фенилаланин; е) серин; ж) пролин; з) лейцин; и) изолейцин; к) валин; л) метионин; м) треонин; н) гистидин; о) глицин; п) цистеин; р) аргинин.
ТЕСТ 1. Тема: «БЕЛКИ». В II
- Белки состоят из мономеров: а) глюкозы; б) нуклеотидов; в) аминокислот.
- Сколько аминокислот участвуют в синтезе белка: а) 23; б)20; в) 100?
- Какая частью аминокислоты отличается друг от друга: а) радикалом; б) аминогруппой;
в) карбоксильной группой.
- Вторичная структура белка образована типами химических связей: а) ионными;
б) ковалентными; в) водородными; г) гидрофобными.
- Третичная структура белка образована типами химических связей: а) ионными;
б) ковалентными; в) водородными; г) гидрофобными.
- Первичная структура белка образована типами химических связей: а) ионными;
б) пептидными; в) водородными; г) гидрофобными; д) ковалентными полярными.
7. Посредством какой химической связи соединены между собой аминокислоты первичной структуры: а) дисульфидной; б)пептидныой; в) водородной.
8. Вторичная структура белка имеет вид: а) нити; б) спирали; в) глобулы.
9. Третичная структура белка имеет вид: а) нити; б) спирали; в) глобулы.
10. К незаменимым аминокислотам относятся: а) лизин; б) аланин; в) тирозин; г) триптофан; д) фенилаланин; е) серин; ж) пролин; з) лейцин; и) изолейцин; к) валин; л) метионин; м) треонин; н) гистидин; о) глицин; п) цистеин; р) аргинин; с) лизин.
.
Актуализация опорных знаний и мотивация учебной деятельности
- Что вы знаете о химических реакциях, которые протекают в живых организмах? Чем они отличаются от реакций, протекающих в неживой природе?
- Что вы знаете о катализаторах, каковы их свойства? Какие условия необходимы для действия тех или иных катализаторов?
- Известно, что молекула перекиси водорода расщепляется под действием каталазы на воду и молекулярный кислород. Как вы думаете, сколько молекул перекиси водорода может расщепить одна молекула каталазы за одну секунду?
Ответ 1: Реакции в живых организмах протекают быстрее в 1000 –чи раз.
Они отличаются не только скоростью, но и условиями их протекания, т.к. протекают при низких температурах, как в кислой так и в щелочной среде и др.
Ответ 2: Катализаторы – это вещества, определяющие скорость химических реакций. В разных условиях они ускоряют или замедляют скорость химических реакций.
Ответ 3: Каталаза – один из наиболее быстро работающих ферментов: при 0 градусов по Цельсию одна молекула каталазы разлагает за 1 сек до 40 000 молекул перекиси водорода!
Что вы знаете о ферментах (биологических катализаторах)? Как бы без них протекали реакции и к чему бы это привело?
НОВЫЙ МАТЕРИАЛ.
ФЕРМЕНТЫ – это биологические катализаторы, способные ускорять химические реакции
в клетке в десятки тысяч раз. Изучает ферменты наука энзимология.
ОСНОВНЫЕ СВОЙСТВА ФЕРМЕНТОВ,
ВСЕ ФЕРМЕНТЫ – глобулярные белки.
ФЕРМЕНТЫ увеличивают скорость реакций, но сами в этой реакции не расходуются.
ФЕРМЕНТЫ высоко специфичны: один фермент может катализировать только одну реакцию.
ФЕРМЕНТ всегда больше субстрата, с которыми он взаимодействует.
ФЕРМЕНТ в малом количестве вызывает превращения большого количества субстрата.
ФЕРМЕНТ своим присутствием не влияет ни на свойства, ни на природу конечного продукта.
ФЕРМЕНТ взаимодействует из субстратом с помощью АЦ (К — 10 — 20 аминокислот) специфического участка, который по форме соответствует субстрату.
Катализируемая им реакция обратима.
Активность ферментов зависит от t, рН среды, температуры, давления и от концентрации как субстрата так и самого фермента.
Фермент – субстратный комплекс способен снижать энергию начала реакции, это и позволяет ферменту ускорить протекание реакции.
СТРОЕННИЕ ФЕРМЕНТА.
АПОФЕМЕНТ – БЕКОВАЯ ЧАСТЬ ФЕРМЕНТА;
Орг — е в — ва: белки или близкие к витаминам в – ва (гормоны)
КОФЕРМЕНТ — небелковая часть фермента,
Активная часть фермента.
МЕХАНИЗМ ДЕЙСТВИЯ ФЕРМЕНТА.
«КЛЮЧА И ЗАМКА» «РУКИ И ПЕРЧАТКИ»
1890 г. Фишер
СУБСТРАТ ФЕРМЕНТ СУБСТРАТ ФЕРМЕНТ
Главная часть замка – активный центр. Форма субстрата соответствует активному центру.
Фермент – субстратный комплекс существует короткое время. Образовавшиеся продукты реакции поступают в окружающую среду. Комплекс распался и готов принимать новый субстрат. Активный центр не жестко подходит к субстрату как «рука в перчатку».
Каталаза — м = 250 000; Перекись водорода – м = 34.
ЭТАПЫ ДЕЙСТВИЯ ФЕРМЕНТА.
- Приближение субстрата к активному центру;
- Вхождение С (субстрата) в активный центр;
- Перестройка субстрата в продукт реакции;
- Выход продукта реакции из активного центра.
СВОЙСТВА БЕЛКОВ.
ДЕНАТУРАЦИЯ РЕНАТУРАЦИЯ ДЕСТРУКЦИЯ
Нарушение высших уровней организации белковой молекулы (вторичной, третичной, четвертичной структур белка из сохранением первичной структуры).
ПРИЧИНЫ.
1)температура; 2) давление; 3) рН среды – кислая или щелочная; 4) ультразвук; 5) вещества.
ЖИВОЙ __________________ РАЗВЕРНУТЫЙ ________________ РЕНАТУРАЦИЯ
БЕЛОК денатурация (t, р, рН) БЕЛОК если не нарушена I стр – ра белка
КАТАЛАЗА УТРАТИЛА СВОЙСТВА ВОССТАНОВИЛА СВОЙСВА
Лабораторная работа
ТЕМА. Свойства белков. Определение свойств ферментов.
ЦЕЛЬ: выявить каталитическую активность ферментов в живых тканях.
Оборудование: перекись водорода, сырой и вареный картофель, сырое и вареное мясо, про бирки, штативы, стеклянные палочки, проросшие семена гороха, термометр.
ХОД РАБОТЫ.
В приготовленные пробирки добавьте несколько капель перекиси водорода. Наблюдаемое запишите в таблицу:
№ п/п | Исследуемый объект | Действие перекиси водорода | Наблюдения |
1. | Сырой картофель | Каталаза + перекись водорода | Вскипание в пробирке;Ф ката-лаза расщепляет яд до про-стых в-в: воды и кислорода |
2. | Вареный картофель | Деструкция Ф каталазы + перек. водород Кипячение | Реакции не протекают, т.к. нарушена нативная структура белка – фермента при кипячен. |
3. | Сырое Мясо | Каталаза + перекись водорода | Вскипание в пробирке;Ф ката-лаза расщепляет яд до про-стых в-в: воды и кислорода |
4. | Вареное мясо | Деструкция Ф каталазы + перек. водород Кипячение | Реакции не протекают, т.к. нарушена нативная структура белка – фермента при кипячен. |
5. | Сырое семя гороха | Каталаза + перекись водорода | Вскипание в пробирке;Ф ката-лаза расщепляет яд до про-стых в-в: воды и кислорода |
6. | Вареное семя гороха | Деструкция Ф каталазы + перек. водород кипячение | Реакции не протекают, т.к. нарушена нативная структура белка – фермента при кипячен. |
ВЫВОД. Денатурированный белок не взаимодействуют с перекисью водорода с выделением конечных продуктов воды и кислорода, а белок – фермент каталаза в живых клетках за доли секунды разрушает яд, перекись водорода, до простых веществ.
II часть. НОВЫЙ МАТЕРИАЛ.
БИОЛОГИЧЕСКАЯ РОЛЬ БЕЛКОВ. ФУНКЦИИ ФЕРМЕНТОВ.
№ П/п | Группы белков | ВИДЫ | ФУНКЦИИ | ПРИМЕРЫ |
1. | Структурные | кератин коллаген | строительная опорная | Входит в состав волос, ногтей, копыт, рогов Компонент сухожилий, связок, и хрящей |
2. | Гормоны | инсулин вазопрессин | регуляторная ——— « ——— | Регулируют обмен веществ |
3. | Сократительные | актин миозин | двигательная ——— « ——- | Осуществляют мышечные сокращения |
4. | Запасные | козеин ферритин | запасающая ——- « ——- | Белок в молоке железо в селезенке |
5. | Транспортные | Гемоглобин альбумин | перенос веществ —— «——— | Перенос О и СО Перенос жирных кислот |
6. | Защитные | антитела | иммунная | Защищают организм от бактерий, вирусов, антигенов, чужеродных белков |
7. | Сигнальная | рецепторы иодопсин родопсин | Рефлекторная, передает сигналы из внешней среды | Осуществляет взаимосвязь организма и окружающей среды |
8. | токсины | нейротоксин | блокирующее | Блокирует передачу нервного импульса |
9. | Энергетическая | все | все | При расщеплении 1г-7,8 кДж |
10. | Ферментативная | каталаза амилаза инсулин глюкогон ДНКполимераза уреаза | каталитическая | Расщепляет Н О Расщепляет крахмал превращ-т крахмал в глюкозу превращ-т глюкозу в крахмал осущ-т репарацию мол-л ДНК разложение мочевины |
Свойства белков обусловлены аминокислотным составом белков.
Протамины – содержащиеся в икре рыб, где их до 30 % аминокислот с двумя аминогруппами, что обуславливает щелочные свойства этих белков.
Химическая активность веществ в живой клетке невелика.
- Концентрация их в клетке ничтожно мала.
- В клетке низкая t.
- Реакции идут очень быстро и качественно потому, что химические реакции регулируются белками – катализаторами.
- Для каждого фермента существует определенное значение реакции среды, при котором он проявляет наивысшую активность
- Изменение рН вызывает снижение или полное торможение деятельности фермента.
- Изменение t вызывает изменение скорости и ход ферментативной реакции.
Пример: разложение мочевины (кошачьей мочи) уреазой (выработанной бактериями)
при комнатной t (1 мол уреазы за 1 сек расщепляет 30 000 мол мочевины) –
Н N- СО- NН + Н О ———- СО + 2 NН (запах аммиака).
III. ЗАКРЕПЛЕНИЕ.
- Почему все ферменты глобулярные белки?.Чем ферменты отличаются от катализаторов в неживой природе?
- Почему активность ферментов зависит от t среды?
- Одни ферменты активны в кислой среде, а другие — в щелочной. Как вы это можете объяснить?
- Известно, что один фермент катализирует только одну реакцию. Объясните, почему невозможно с помощью этого же фермента ускорить любую реакцию?
ТЕСТ 2. Тема. «Свойства и функции белков. Выходное.
1.Процесс восстановления структуры белка после ее нарушения называется: а) деструкция; б) денатурация; в) ренатурация; г) биосинтезом.
2. К растворимым в воде органическим веществам относятся: а) липиды; б) моносахариды; в) полисахариды; г) некоторые белки.
3При расщеплении 1 г белка выделяется энергия: а) 17,8 кДж; б) 39,8 кДж; в) 178 кДж.
4Ускорение биохимических реакций обеспечивают: а) алкалоиды; б) гормоны; в) белки (ферменты)
5Антитела имеют природу: а) белковую; б) углеводную; в) липидную.
6В полипептидную цепь аминокислоты соединяются благодаря: а) водородным связям; б) ковалентным связям; в) гидрофобным; г) ионным.
7Вторичная структура белка имеет вид: а) глобулы; б) спирали; в) цепи аминокислотных остатков.
8Процесс разрушения первичных пептидных связей называют: а) денатурация; б) деструкция; в) ренатурация.
l l вариант.
- В состав молекулы белков входят химические элементы: а) С; б) К; в) Н ; г) О ; д) Са; е) N ; ж) S; з) Fe.
- Активная часть белка – фермента, обеспечивающая каталитические свойства:
а) апофермент; б) кофермент.
- Сократительную функцию выполняют белки: а) протеины; б) миозин; в) кератин;
в) актин.
- Каталитическую функцию выполняют белки: а) каталаза; б) миозин; в) кератин;
в) уреаза;
- Транспортную функцию выполняют белки: а) гемоглобин; б) миозин; в) кератин;
в) актин.
- Защитную функцию выполняют белки: а) коллаген; б) иммуноглобулины; в) тромбо-пластин; г) тромбин; д) фибриноген.
- Строительную (структурную) функцию выполняют белки: а) коллаген; б) кератин;
в) инсулин.
8. Какие структуры молекул белка способны разрушаться при денатурации, а затем, вновь восстанавливаться: а) первичная; б) вторичная; в) третичная; г) четвертичная?
IV. ДОМАШНЕЕ ЗАДАНИЕ: учить &5 и конспект урока, подготовить
нформацию о роли белков в организме,повторить биологические термины.
V. ИТОГ УРОКА.
Подвести обучающихся к следующим выводам:
Свойства белков обусловлены аминокислотным составом белков.
Без участия ферментов протекание большинства биохимических процессов в клетке было бы невозможным.
В результате ферментативных реакций не образуются побочные продукты, то есть наблюдается почти 100% выход конечного продукта.
Для нормального функционирования организма это имеет большое значение, т.к. все вещества, распавшиеся до конечных продуктов – воды и углекислого газа, выводятся полностью наружу из организмов, при этом не накапливаются ненужные вещества в ЖО.
.
Урок биологии «Функции белков», 10 класс
Учитель Ефимова Г.В.
Цель урока: используя знания о строении и свойствах белков расширить представления о функциях белков через творческую и исследовательскую деятельность (Слайд №2).
Задачи (Слайд №3)
Образовательная:
Расширить знания о белках как природных полимерах, о многообразии их функций во взаимосвязи со строением и свойствами.
Развивающие:
1.Развивать мышление учащихся и умение устанавливать причинно-следственные связи на примере изучения свойств и функций белка.
2. Развивать практические умения постановки цитологических опытов при установлении роли белков ферментов.
3. Развивать умение делать выводы на основе практических работ, развивать умение самостоятельно получать информацию из дополнительных информационных источников (информационная компетентность).
4.Развивать умение структурировать материал.
5. Формировать способность рефлексировать свою деятельность.
Воспитательная:
1.Воспитывать умение работать в группе
2. Воспитывать аккуратность учащихся при выполнении и оформлении практических работ и записей в тетради.
Тип урока: комбинированный с использованием исследовательской деятельности.
Технологии: тестовая, ИКТ, проблемного обучения.
Методы: частично-поисковый, словесный, наглядный, исследовательский.
Оборудование: презентация «Функции белков», компьютер с мультимедийным проектором, лабораторное оборудование к исследованию по теме «Ферментативная функция белка»: чашки петри, пероксид водорода, пипетка, кусочки вареного и сырого мяса, вареного и сырого картофеля, речной песок.
Методическое обеспечение:
Раздаточный материал – текст «Белки» (Приложение №2), инструктивная карточка к лабораторной работе «Ферментативная функция белков» (Приложение №3), задание на установление соответствия между белками и их функциями (Приложение №4).
Презентация Microsoft PowerPoint «Функции белков» (Приложение №1) – (POWER POINT).
Актуальность использования средств ИКТ
Возможность представления в мультимедийной форме уникальных информационных материалов.
Ход урока:
1.Организационное начало урока (приветствие, проверка готовности к работе, психологический настрой на урок) (Слайд № 4).
Притча.
“Жил мудрец, который знал все. Один человек захотел доказать, что мудрец знает не все. Зажав в ладонях бабочку, он спросил: “Скажи, мудрец, какая бабочка у меня в руках: мертвая или живая?” А сам думает: “Скажет живая – я ее умерщвлю, скажет мертвая – выпущу”. Мудрец, подумав, ответил: “Все в твоих руках”.
В наших руках сегодня создать такую атмосферу на уроке, при которой все будут чувствовать себя комфортно.
Эпиграфом нашего урока будут слова А. Эйнштейна «Радость видеть и понимать есть величайший дар природы» (Слайд №5).
2.Мотивация
Задание: сделайте анализ круговой диаграммы (Слайд №6) и ответьте на вопросы:
1). Каков химический состав клетки?
2). Каких веществ органической природы в клетке больше?
3). О чем свидетельствует сходство химического состава клеток?
«Жизнь — это способ существования белковых тел» (Ф. Энгельс) (Слайд №7).
Ни одно вещество химики не изучали так долго, как белок прежде, чем удалось разгадать их строение. От первых шагов на пути познания состава белка до расшифровки структуры прошло более двухсот лет.
Любой биологический объект, начиная от вирусов и заканчивая человеком, состоит в основном из белков (в пересчете на сухое вещество),
поэтому очень важно знать строение, свойства и функции этих соединений.
3.Личностная значимость изучаемого материала.
В сутки человек должен обязательно употреблять 100 г белка, иначе разовьется белковое голодание.
(Слайд №8) Недостаток белков в питании вызывает у детей замедление роста и развития, а у взрослых — глубокие изменения в печени, нарушение деятельности желез внутренней секреции, изменение гормонального фона, ухудшение усвоения питательных веществ, проблемы с сердечной мышцей, ухудшение памяти и работоспособности.
В 70 годах отмечались смертельные случаи у людей, длительное время соблюдающих низкокалорийные диеты с выраженным недостатком белка. Происходило это из-за серьезных нарушений в деятельности сердечной мышцы. Дефицит белка уменьшает устойчивость организма к инфекциям. Кроме того, белковая недостаточность часто сопровождается авитаминозом В12, А, Д, К и так далее, что также влияет на состояние здоровья.
Вопрос к учащимся: «Какой личностный смысл для каждого из Вас имеют эти факты?»
Целеполагание
Задание:
Установите соответствие между белками и их функциями
(Слайд №9).
Белки: Функции
А. Кератин 1. Строительная
Б. Гемоглобин 2. Запасающая
В. Актин 3. Защитная
Г. Антитела 4. Двигательная
Д. Миозин 5. Транспортная
Е. Фибриноген 6. Ферментативная
Ж. Коллаген 7. Регуляторная
З. Альбумин
И.Каталаза
К. Пепсин
Л.Инсулин
Почему Вы не можете выполнить данное задание? (ответ: не хватает знаний)
Постановка проблемного вопроса. В состав клетки входят белки, жиры, углеводы, нуклеиновые кислоты, вода, минеральные вещества, но ни одно из веществ не выполняет столь специфичных функций, как белки. Справедливо ли это?
Учащиеся ставят цели и задачи работы на данном уроке.
5.Актуализация знаний.
Задания:
1.Работа со слайдами № 10, 11,12,13,14,15 и беседа по вопросам:
1). Что такое полимеры?
2) Используя схему, ответьте доказательно, к каким полимерам относятся белки?
3) Строение мономера белка.
4). Характеристика структурной организации белка.
2. Работа с текстом «Белки» (Слайд №16).
Вставьте в текст пропущенные термины и слова.
1). В состав белка входят следующие элементы___,___,____,___,____. 2).Белки – _______________,___________________ полимеры,
мономерами которых являются ____________________. 3).В состав природных белков входят ______ аминокислот, ___ из них незаменимые, т.е. синтезируются в организме и их поступление в организм не обязательно вместе с пищей. 4).Мономеры белка состоят из ___________,_________________.________________. 5).В состав всех мономеров белка входят___________,________________, а отличаются_______________.
6). Денатурация – процесс изменения нативной структуры белка.
6. Изучение нового материала
Свойства и функции белка определяются его структурой, строением и многообразием, поэтому даже малые его дефекты структуры имеют серьезные последствия.
Наследственное заболевание серповидно-клеточная анемия связано с тем, что при синтезе гемоглобина, состоящего приблизительно из 600 аминокислотных остатков, два из них заменяются на другие. Это приводит к нарушению функции гемоглобина: эритроциты больных приобретают серповидную форму и утрачивают способность к нормальному переносу кислорода (Слайд №17).
Это пример связи структуры и функции макромолекул.
Вам заранее было дано задание «Проанализировать информационные ресурсы сети-Интернет и составить несколько слайдов», а также сегодня мы проведем исследование. Данная деятельность позволит нам выяснить функции белков (Слайд 19-27)
Результатом данной работы будет таблица, которую по ходу работы будем заполнять.
Функции белков (Слайд №18).
Функция | Сущность | Пример |
Структурная | Образование мембраны клеток и органоидов и др. структур | Коллаген, кератин |
Регуляторная | Регулирование обмена веществ в организме | Некоторые гормоны – инсулин, глюкагон |
Защитная | 1. При попадании в организм чужеродных белков и микроорганизмов в лейкоцитах образуются защитные белки. 2. Защита от потери крови при ранении в результате свертывания | Антитела Фибриноген |
Транспортная | Присоединение и перенос химических элементов по организму | Гемоглобин |
Сократитель-ная | Осуществление всех типов движения | Актин, миозин |
Запасающая | Резерв для организма, плода | Яичный альбумин, казеин молока. |
Токсическая | Змеиный яд, дифтерийный токсин | |
Энергетичес-кая | Не основной, но источник энергии в клетке | Расщепление 1 г белка – 17 кДж |
Сигнальная | Узнавание молекул мембраной клетки | Гликопротеины |
Ферментативная или ката-литическая | Каталитическое ускорение биохимических реакций в клетке | Белки-ферменты (каталаза, пепсин, трипсин) |
Учащиеся представляют выполненную презентацию.
Давайте вспомним: «О чем в ядре клетки хранится наследственная информация» (представить логическую цепь: признак-вещество-реакция-белок-фермент). Павлов назвал ферменты «возбудителями жизни и первым актом жизненной деятельности».
Среди многочисленных функций белков особое место занимает ферментативная.
Наука о ферментах называется энзимологией, а ферменты – энзимами
Выражение И.П. Павлова «Не все белки – ферменты, но все ферменты белки» подчеркивают их химическую организацию.
Далее учитель объясняет строение и механизм действия фермента.
Чем же объясняется ускоряющее действие ферментов? (Слайд №28,29)
Каждый фермент имеет активный центр — определенная группа аминокислотных остатков. В активном центре происходит соединение фермента с субстратом (вещество, которое подлежит превращению) Форма активного центра и субстрата подходят друг другу как ключ к замку.
Процесс действия ферментов можно разделить на три стадии:
Фермент распознает субстрат и связывается с ним.
Образуется активный комплекс, состоящий из фермента и субстрата.
Отделение продукта в результате ферментативной реакции.
Свойства ферментов (анализ графиков) (Слайд 30-33)
Далее учащимся предлагается выполнить исследование.
Исследовательское задание
Лабораторная работа
«Ферментативное расщепление пероксида водорода в тканях организма»
Цель: сформировать знания о роли ферментов в клетках, закрепить умения проводить опыты и объяснять результаты работы.
Оборудование: свежий 3%-ный раствор пероксида водорода, штатив с пробирками, ткани растений (кусочки сырого и варёного картофеля) и животных (кусочки сырого и варёного мяса), пипетки, песок.
Ход работы:
1.Приготовьте четыре пробирки и поместите в первую пробирку — кусочек сырого картофеля, во вторую— кусочек варёного картофеля, в третью— кусочек сырого мяса, в четвёртую — кусочек варёного мяса. Капните в каждую из пробирок немного пероксида водорода. Пронаблюдайте, что будет происходить в каждой из пробирок.
2.Составьте таблицу, показывающую активность каждой ткани.
«Результаты исследования»
№ пробирки | Содержимое | Что делаю? | Что наблюдаю? |
№ 1 | |||
№ 2 | |||
№ 3 | |||
№ 4 | |||
№5 |
Ответьте на вопросы (устно):
В каких пробирках проявилась активность фермента? Объясните почему?
Как проявляется активность фермента в живых и мёртвых тканях? Объясните наблюдаемое явление.
Различается ли активность фермента в живых тканях растений и животных?
Как вы считаете, все ли живые организмы содержат фермент каталазу, обеспечивающую разложение пероксида водорода?
Ответ обоснуйте.
Сделайте вывод.
Группы учащихся отчитываются о выполнении задания.
7. Рефлексия. Учащиеся выполняют задание, делают вывод (Слайд № 34).
8.Домашнее задание (Слайд № 35): параграф, найти классификацию ферментов в Интернете.
Интернет-ресурсы:
www.biology.asvu.ru — все о биологии.
www.biodev.ru — все о биологии.
Синтез ДНК и белка 10 класс
Руки на моделирование мутации
Руки на моделирование мутации Шарлотта К.Омото П.О. Вставка 644236 Вашингтонский государственный университет, Пуллман, Вашингтон 99164-4236 [email protected] РЕЗЮМЕ Это упражнение представляет собой практическое моделирование мутаций и их
Дополнительная информацияПРАКТИКА ТЕСТОВЫЕ ВОПРОСЫ
ЧАСТЬ A: ВОПРОСЫ ДЛЯ МНОЖЕСТВА ВЫБОРА ПРАКТИКА ВОПРОСЫ ДЛЯ СИНТЕЗА ДНК И БЕЛКА B 1. Одна из функций ДНК состоит в том, чтобы A. секретировать вакуоли. Б. сделать копии самого себя. C. соединяют аминокислоты друг с другом.
Дополнительная информацияТаблица S1. Относится к рисунку 4
Таблица S1. Относится к рисунку 4 Окончательная диагностика Возраст PMD Control Control 61 15 Control 67 6 Control 68 10 Control 49 15 AR-PD PD 62 15 PD 65 4 PD 52 18 PD 68 10 Зубчатая кора AR-PD, используемая для иммуноблота
Дополнительная информацияОбнаружение гена CMSC 423
Обнаружение гена CMSC 423 Обнаружение сигналов в ДНК У нас просто есть длинная цепочка A, C, G, Ts.Как мы можем найти сигналы, закодированные в нем? Предположим, вы столкнулись с языком, которого не знали. Как бы вы расшифровали
Дополнительная информацияМодуль 6: Цифровая ДНК
Модуль 6: Цифровая ДНК Представление и обработка цифровой информации в форме ДНК имеет важное значение для жизни всех организмов, независимо от их размера или размера. Вычислительные инструменты и вычислительное мышление
Дополнительная информация2006 7.012 Набор задач 3 KEY
2006 7.012 Задача поставлена 3-х КЛЮЧЕВЫЕ до 5 часов вечера в пятницу, 13 октября 2006 года. Включите ответы в поле за пределами 68-120. ПОЖАЛУЙСТА, НАПИШИТЕ СВОИ ОТВЕТЫ НА ЭТОТ ПРИНТ. 1. Какая реакция катализируется каждым
Дополнительная информацияРУКОВОДСТВО ПО МУТАЦИИ Р53
РУКОВОДСТВО ПО МУТАЦИИ p Версия 1. / 7 Тьерри Сусси Кристоф Бероуд, Далил Хамрун Жан Мишель Рубио Невадо http: // p / free.Справочник по мутации Т. Сусси, Дж. М. Рубио-Невадо, Д. Хамруна и С.
Дополнительная информацияМолекулярные факты и цифры
Нуклеиновые кислоты Молекулярные факты и цифры Основания ДНК / РНК: ДНК и РНК состоят из четырех оснований каждое. В ДНК четыре являются аденин (A), тимидин (T), цитозин (C) и гуанин (G). В РНК четверка
Дополнительная информация13.2 рибосомы и синтез белка
13.2. Рибосомы и синтез белка. Введение: * Определенная последовательность оснований в ДНК несет в себе указания для образования полипептида, цепочки аминокислот (существует 20 различных типов аминокислот).
Дополнительная информацияОт ДНК к белку
Центр управления ядром клетки содержит генетическую библиотеку, закодированную в последовательностях нуклеотидов в молекулах ДНК, для кодирования аминокислотных последовательностей всех белков определяется, какие именно белки
Дополнительная информацияСеквенирование следующего поколения
Секвенирование следующего поколения 38.Informationsgespräch der Blutspendezentralefür Wien, Niederösterreich und Burgenland Österreichisches Rotes Kreuz 22. Ноябрь 2014, Парк-отель Schönbrunn Die Zukunft hat
Дополнительная информацияРНК и синтез белка
Name lass Date RN и информация о синтезе белка и наследственность Q: Как информация передается от DN к RN для управления синтезом белков? 13.1 Что такое RN? ЧТО Я ЗНАЮ, ПОЧЕМУ НУЖНЫЙ: РН — ядро
Дополнительная информацияРуководство по переводу
Учебное пособие по переводу Это учебное пособие является письменной версией материала, который вы видели в блоке тиражирования.В переводе клетка использует генетическую информацию, содержащуюся в мрне до
Дополнительная информацияРНК и синтез белка
РНК и синтез белка Гены посылают сообщения клеточному механизму. РНК играет главную роль в процессе. Процесс имеет три фазы (генетическая) транскрипционная (генетическая) трансляция синтез белка. РНК-синтез
Дополнительная информацияСтруктура и функция ДНК
Структура и функции ДНК ДНК и РНК Структура ДНК и РНК являются нуклеиновыми кислотами.Они состоят из химических единиц, называемых нуклеотидами. Нуклеотиды соединены сахарофосфатным остовом. Четыре
Дополнительная информацияАНАЛИЗ МОДЕЛИ КРУГОВОГО КОДА
АНАЛИЗ МОДЕЛИ КРУГОВОГО Кода Дополнительная информация
Моделирование синтеза белка
Моделирование синтеза белка Имя (я) Дата Период Контрольный ориентир: SC.912.L.16.5 as AA: Объясните основные процессы транскрипции и трансляции и как они приводят к экспрессии генов. (Оценено
Дополнительная информацияГены дрозофилы NK-гомеобокса
1 Мутация и генетическое изменение
ГЛАВА 14 1 Мутация и генетические изменения РАЗДЕЛ Гены в действии КЛЮЧЕВЫЕ ИДЕИ Когда вы читаете этот раздел, помните о следующих вопросах: каково происхождение генетических различий между организмами? Какие виды
Дополнительная информацияСоздание Музыки Геномы
242 Резюме Ключевые слова Resumen Palabras clave Создание Genoma Music Aurora Sánchez Sousa 1, Fernando Baquero 1 и Cesar Nombela 2 1, отделение микробиологии, больница Ramón y Cajal, и 2 отделение
Дополнительная информацияБиопифон Учебник и Поваренная книга
Учебник и поваренная книга по биопифону Джефф Чанг, Брэд Чэпмен, Иддо Фридберг, Томас Хамелрик, Мичиэль де Хун, Питер Кок Последнее обновление сентябрь 2008 г. Содержание 1 Введение 5 1.1 Что такое Биопайтон? …………………………………..
Дополнительная информацияДНК- «Волновой биокомпьютер»
ДНК- «Волновой биокомпьютер» Петр Петрович Гаряев (Петр Гаржаев) *, Борис Иванович Бирштейн *, Александр Михайлович Яроченко *, Питер Дж. Марсер **, Георгий Георгиевич Тертишный *, Екатерина Леонова *, Уве Кемпф ***. * Институт
Дополнительная информацияBioBoot Camp Genetics
BioBoot Camp Genetics BIO.B.1.2.1. Описать, как процесс репликации ДНК приводит к передаче и / или сохранению генетической информации. Репликация ДНК — это процесс копирования ДНК до
Дополнительная информация12.1 Роль ДНК в наследственности
12.1 Роль ДНК в наследственности Только за последние 50 лет ученые поняли роль ДНК в наследственности. Это понимание началось с открытия структуры ДНК.В 1952 году Розалинда Франклин
Дополнительная информацияДеятельность 7.21 Транскрипционные факторы
Цель: закрепить понимание синтеза белка. Объяснить роль факторов транскрипции и гормонов в включении и выключении генов. Сыграйте в игру «Инициирование транскрипции» Правила
. Дополнительная информацияУчасток 5 класса
Приложения для чтения подключений по стандартам штата Огайо: контрольный тест по литературному тексту C Определите элементы сюжета и установите связь между элементом и будущим событием.Индикатор 3 Определите основные инциденты
Дополнительная информацияИзменения в нашем небе, второй класс
Соединение стандартов штата Огайо: эталон науки о Земле и космосе A Соблюдайте постоянные и изменяющиеся структуры объектов на дневном и ночном небе. Индикатор 2 Посмотрите и опишите, как солнце, луна и звезды
Дополнительная информацияГенетический модуль B, Якорь 3
Генетический модуль B, Якорь 3 Основные понятия: — Характеристики человека определяются факторами, которые передаются от одного поколения родителей к следующему.- Во время образования гамет аллели на
Дополнительная информация ,Презентация на тему: «Структура и функции белков». Лектор: д-р Ора Фурман, 19-20 октября 2009 г. Зима 2009/10. Помощники преподавателя: Мираим Оксман Сиван Перл. — Стенограмма презентации:
1
Структура и функция белков. Лектор: докторОра Фурман 19-20 октября 2009 Зима 2009/10 Помощники учителя: Мираим Оксман Сиван Перл
2
План упражнений: visual Визуализация молекул: знакомство с Deep-View. Иллюстративные примеры понятий, усвоенных в каждом уроке. Некоторые базовые навыки биоинформатики. Политика начальных классов: 2/3: экзамен 1/3: классы упражнений: 10 упражнений, 8 обязательных. Упражнения выполняются парами и передаются в печатном виде.
3
Что такое PDB? PDB (Protein Data Bank): хранилище для обработки и распространения данных трехмерной биологической макромолекулярной структуры.
4
Файлы PDB (i) Название: название белка и источник белка. АНТИГЕН ГИСТОКОМПАТИВНОСТИ ЖАТКИ 30-ИЮНЬ-93 1HHK 1HHK 2 КОМПОНД ЧЕЛОВЕЧЕСКОГО КЛАССА I АНТИГЕН ГИСТОКОМПОРТИВНОСТИ (HLA-A 0201) 1HHK 3 COMPND 2 КОМПЛЕКС С НОНАМЕРНЫМ ПЕПТИДОМ ИЗ HTLV-1 4-Й УНИВЕРСИТЕТ 1-Й КОМПОНЕНТ 5-Й-4-Й ГУБА ИСТОЧНИК ЧЕЛОВЕКА (HOMO SAPIENS) РЕКОМБИНАНТНАЯ ФОРМА.ВНЕКЛЕТОЧНЫЙ ФРАГМЕНТ 1HHK 6 ИСТОЧНИКА 2, ВЫРАЖЕННЫЙ В (ESCHERICHIA COLI), И 1HHK 7 ИСТОЧНИК 3, ПЕРЕДАННЫЙ С СИНТЕТИЧЕСКИМ ПЕПТИДОМ 1HHK 8 Литература: АВТОР ДРМАДДЕН, DNGARBOCZI, DCWILEY 1HHH ДГНД 1-Й-Й-О-ОД 1-Й-Й-О-ОД 1-Й-Й-ОД Мэдден, DNGARBOCZI, DCWILEY 1HHK 11 JRNL TITL АНТИГЕННАЯ ИДЕНТИЧНОСТЬ ПЕПТИДА (SLASH) MHC 1HHK 12 JRNL TITL 2 КОМПЛЕКСА: СРАВНЕНИЕ СООТВЕТСТВИЯ ПЯТИ 1HHK 13 JRNH TITL 2 ПЕФТА ПРЕТИДА JRNL REF БУДЕТ ОПУБЛИКОВАН 1HHK 15N.GARBOCZI, D.T.HUNG, D.C.WILEY 1HHK 18 ЗАМЕЧАНИЕ 1 TITL / HLA $ — * А2-ПЕПТИДНЫЕ КОМПЛЕКСЫ: УСТАНОВКА И 1HHK 19
5
Файлы PDB (ii) Информация о структурной модели белка: данные кристаллизации и уточнения. ЗАМЕЧАНИЕ 2 РАЗРЕШЕНИЕ. 2.5 АНГСТРОМ. 1HHK 69 ЗАМЕЧАНИЕ 3 УЛУЧШЕНИЕ. 1HHK 71 ЗАМЕЧАНИЕ 3 ПРОГРАММА X-PLOR 1HHK 72 ЗАМЕЧАНИЕ 3 АВТОРА BRUNGER 1HHK 73 ЗАМЕЧАНИЕ 3 R ЗНАЧЕНИЕ 0.262 1HHK 74 ЗАМЕЧАНИЕ 3 RMSD RONDD BOND DISTANCE 0.014 ANGSTROMS 1HHK 75 ЗАМЕЧАНИЕ 3 RMSD ОБЛИГАЦИИ УГЛОВ 2.9 СТЕПЕНИ 1HHK 76 Документы о белковых цепях, доменах и т. Д. ЗАМЕЧАНИЕ 4 ТАМ ДВУХ КОМПЛЕКСА НА АСИММЕТРИЧЕСКУЮ ЕДИНИЦУ, КАЖДЫЙ СОСТАВЛЕННЫЙ 1HHK 78 НА ЗАМЕТКУ 4-ГОЛЬФСКОГО РОДА В 1-Й КОМПАНИИ В 3-Й УНЦ. : 1HHK 81 ЗАМЕЧАНИЕ 4 1. ТЯЖЕЛАЯ ЦЕПЬ HLA ОПРЕДЕЛИЛАСЬ ЦЕПЬЮ * A * В ЭТОЙ ВХОДЕ. 1HHK 82 ЗАМЕЧАНИЕ 4 ЭТА ЦЕПЬ РАЗДЕЛЕНА В ТРИ ДОМЕНА 1HHK 83 ЗАМЕЧАНИЕ 4 АЛЬФА 1 — ОСТАВЛЕНЫ ГЛИ А 1 ЧЕРЕЗ АЛА A 90 1HHK 84 ЗАМЕЧАНИЕ 4 АЛЬФА 2 — ОСТАВЛЕНЫ СЛИШКОМ 91 ЧЕРЕЗ ALH 2 ЧАСТЬ 2 РЕЗЮКА 2-Й РЕГИОНАЛЬНАЯ ЧАСТЬ 2 182 1HH A 183 ЧЕРЕЗ КЛЕЙ A 275 1HHK 86 ЗАМЕЧАНИЕ 4 2.Бета-2-микроглобулин идентифицирован как цепь * B *. ЭТО 1HHK 88 ЗАМЕЧАНИЕ 4 ЦЕПЬ СОСТОИТ ИЗ ОСТАТКОВ МЕТ B 0 ЧЕРЕЗ МЕТ B 99. 1HHK 89 ЗАМЕТКА 4 3. НАЛОГОВЫЙ ПЕПТИД HTLV-1, ИДЕНТИФИЦИРОВАННЫЙ КАК ЦЕПЬ * C *. ЭТО 1HHK 91 ЗАМЕЧАНИЕ 4 СЕТЬ СОСТОИТ ИЗ ОСТАТКОВ НОУ C 1 ЧЕРЕЗ VAL C 9. 1HHK 92
6
Файлы PDB (iii) Последовательность белков: указана для каждой цепочки. ПОСЛЕДНИЕ 1 A 275 ЧЕРНЫЙ ГЛР THR TRP АЛА ГЛИСЕР СЕРСИ МЕТ АРГ ТИР ФЕ 1HHK 111 ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ 2 A 275 ФЕВЕРС СЕР ВАЛ СЕР АРГ ПРО ГЛЫЙ АРГ ГЛИ ГЛЮ ПРО АРГ 1HHK 112 SEQRES 3 A 275 PHE ILE ALA VAL GLY TYR VAL ASP ASP THR GLN PHE VAL 1HHK 113 Дополнительная информация о специфических остатках: FTNOTE 1 БОКОВАЯ ЦЕПЬ АТОМОВ A 17, A 194, A 196, B 48, B 58, D 17, 1HHK 174 FTNOTE 1 D 194, D 196, E 48 и E 58 НЕСОПРЕДЕЛЕНЫ, И ИМЕЮТ 1HHK 175 FTNOTE 1 ЗАНЯТИЯ, РАВНЫЕ ДЛЯ НУЛЯ В ЭТОЙ ВХОДЕ.1HHK 176 Определение вторичной структуры и дисульфидных связей: HELIX 1 h2 ALA A 49 GLU A 53 1 1HHK 184 HELIX 2 h3 PRO A 57 TYR A 84 1 1HHK 185 … SHEET 1 SA 8 GLU A 46 PRO A 47 0 1HHK 196 ЛИСТ 2 SA 8 THR A 31 ASP A 37 -1 O ARG A 35 N GLU A 46 1HHK 197 …
7
Файлы PDB (iv) Структура белка: координаты (координаты используются Deep-View для отображения структуры на экране): структура на экране): 1.номер атома 2. тип атома 3. тип остатка 4. имя цепочки 5. номер остатка 6.x-координаты 7.y-координаты 8.z-координаты 9.B-фактор 1 2 3 4 5 6 7 8 9 ATOM 1 N GLY A 1 14,851 -6,104 13,115 1,00 30,79 1HHK 273 ATOM 2 CA GLY A 1 15,76 -5,423 12,197 1,00 28,36 1HHK 274 ATOM 3 C GLY A 1 15,249 -3,991 12,170 1,00 26,32 1HHK 275 ATOM 4 O GLY A 1,6,6 3,545 13,170 1,00 26,79 1HHK 276 ATOM 5 N SER A 2 15,443 -3,339 11,045 1,00 24,58 1HHK 277 ATOM 6 CA SER A 2 15,070 -1,952 10,856 1,00 22,79 1HHK 278
8
Технические замечания Расширения файлов .Файлы pdb представлены в виде файлов .txt. При загрузке файлов выберите вкладку «все типы файлов». Рекомендация Используйте оглавление! Следуйте «рукам»
9
Информация о веб-сайте Упражнения адрес веб-сайта: http://courses.md.huji.ac.il/81817 Адрес веб-сайта лекций (портал EDU): https://eduportal.ekmd.huji.ac.il/default.aspx (курс № 81817). ) путь sPDBv: (с рабочего стола терминала EKMD) Приложения для студентов> Биоинформатика> sPDBv open 2 windows Сайт упражнений по программному обеспечению
10
Как открыть счет в EKMD? Http: // AGCC.ekmd.huji.ac.il/ekmd.asp Откройте этот веб-сайт: вам понадобятся 1-ые 8 цифр вашего идентификационного номера 4-значный код Следуйте инструкциям…
Четыре типа белковой структуры
- Классы
- Класс 1 — 3
- Класс 4 — 5
- Класс 6 — 10
- Класс 11 — 12
- КОНКУРСЫ
- BBS
- 000000000 Книги
- NCERT Книги для 5 класса
- NCERT Книги Класс 6
- NCERT Книги для 7 класса
- NCERT Книги для 8 класса
- NCERT Книги для 9 класса 9
- NCERT Книги для 10 класса
- NCERT Книги для 11 класса
- NCERT Книги для 12-го класса
- NCERT Exemplar
- NCERT Exemplar Class 8
- NCERT Exemplar Class 9
- NCERT Exemplar Class 10
- NCERT Exemplar Class 11
- NCERT Exemplar Class 12 9000al Aggar
Agard Agard Agard Agard Agulis Class 12- Классы
- RS Решения Aggarwal класса 10
- RS Решения Aggarwal класса 11
- RS Решения Aggarwal класса 10 90 003 Решения RS Aggarwal класса 9
- Решения RS Aggarwal класса 8
- Решения RS Aggarwal класса 7
- Решения RS Aggarwal класса 6
- Решения RD Sharma
- Решения класса RD Sharma
- Решения класса 9 Шарма 7 Решения RD Sharma Class 8
- Решения RD Sharma Class 9
- Решения RD Sharma Class 10
- Решения RD Sharma Class 11
- Решения RD Sharma Class 12
- ФИЗИКА
- Механика
- 000000 Электромагнетизм
- ХИМИЯ
- Органическая химия
- Неорганическая химия
- Периодическая таблица
- МАТС
- Теорема Пифагора
- Отношения и функции
- Последовательности и серии
- Таблицы умножения
- Детерминанты и матрицы
- Прибыль и убыток
- Полиномиальные уравнения
- Делительные дроби
- 000000
- 000000
- 000000 ФОРМУЛЫ
- Математические формулы
- Алгебровые формулы
- Тригонометрические формулы
- Геометрические формулы
- КАЛЬКУЛЯТОРЫ
- Математические калькуляторы
- S000
- S0003
- Pегипс Класс 6
- CBSE Образцы документов для класса 7
19-20 октября 2009 Помощники учителя: Мираим Оксман Сиван Перл Структура и функции белков зима 2009/10 Лектор: д-р Ора Фурман
Введение • План упражнений: • Визуализация молекул: знакомство с Deep-View. • Иллюстративные примеры понятий, усвоенных на каждом уроке. • Некоторые базовые биоинформационные навыки. Политика оценок: • 2/3: экзамен • 1/3: упражнения: 10 упражнений, 8 обязательных.• Упражнения выполняются парами и передаются в печатном виде.
Что такое PDB? • PDB (Protein Data Bank): • Хранилище для обработки и распространения данных трехмерной биологической макромолекулярной структуры.
PDB Files (i) Название: название белка и источник белка. АНТИГЕН ГИСТОЛОЖИТЕЛЬНОСТИ ЖАТКИ 30-ИЮНЬ-93 1HHK 1HHK 2 КОМПЛЕКС ЧЕЛОВЕЧЕСКОГО КЛАССА I АНТИГЕН ГИСТОКОМПОРТИВНОСТИ (HLA-A 0201) 1HHK 3 COMPND 2 КОМПЛЕКС С НЕОНАМЕРНЫМ ПЕПТИДОМ ИЗ HTLV-1 TAX 4-Й УНИВЕРСИТЕТ 1-Й КОМПОНЕНТ 5-Й-4-Й ГУБА ИСТОЧНИК ЧЕЛОВЕКА (HOMO SAPIENS) РЕКОМБИНАНТНАЯ ФОРМА.ВНЕКЛЕТОЧНЫЙ ФРАГМЕНТ 1HHK 6 ИСТОЧНИКА 2, ВЫРАЖЕННЫЙ В (ESCHERICHIA COLI), И 1HHK 7 ИСТОЧНИК 3, ПЕРЕДАННЫЙ С СИНТЕТИЧЕСКИМ ПЕПТИДОМ 1HHK 8 Литература: АВТОР ДРМАДДЕН, DNGARBOCZI, DCWILEY 1HHH ДГНД 1-Й-Й-О-ОД 1-Й-Й-О-ОД 1-Й-Й-ОД Мэдден, DNGARBOCZI, DCWILEY 1HHK 11 JRNL TITL АНТИГЕННАЯ ИДЕНТИЧНОСТЬ ПЕПТИДА (SLASH) MHC 1HHK 12 JRNL TITL 2 КОМПЛЕКСА: СРАВНЕНИЕ СООТВЕТСТВИЯ ПЯТИ 1HHK 13 JRNH TITL 2 ПЕФТА ПРЕТИДА JRNL REF БУДЕТ ОПУБЛИКОВАН 1HHK 15 JRNL REFN 353 1HHK 16 ЗАМЕЧАНИЕ 1 ССЫЛКА 1 1HHK 17 ЗАМЕЧАНИЕ 1 АВТОР D.N.GARBOCZI, DTHUNG, DCWILEY 1HHK 18 ЗАМЕЧАНИЕ 1 TITL / HLA $ — * А2-ПЕПТИДНЫЕ КОМПЛЕКСЫ: УСТАНОВКА И 1HHK 19
Файлы PDB (ii) Информация о структурной модели белка: кристаллизация и уточнение данных ЗАМЕЧАНИЕ 2 РАЗРЕШЕНИЕ. 2.5 АНГСТРОМ. 1HHK 69 ЗАМЕЧАНИЕ 3 УЛУЧШЕНИЕ. 1HHK 71 ЗАМЕЧАНИЕ 3 ПРОГРАММА X-PLOR 1HHK 72 ЗАМЕЧАНИЕ 3 АВТОРА BRUNGER 1HHK 73 ЗАМЕЧАНИЕ 3 R ЗНАЧЕНИЕ 0.262 1HHK 74 ЗАМЕЧАНИЕ 3 RMSD РАСШИРЕНИЯ СВЯЗИ 0.014 АНГСТРОМА 1HHK 75 ЗАМЕЧАНИЕ 3 RMSD ОБЛИГАЦИИ УГЛЫ 2.9 ГРАДА 1HHK 76 Документы о белковых цепях, доменах и т. Д. УЗНАЕТ 4 ЕСТЬ ДВА КОМПЛЕКСА НА АСИММЕТ РОДА, СЕНТ-ДЖАЙС, 4-Й РЕГ : 1HHK 79 ЗАМЕЧАНИЕ 4 ОДИН КОМПЛЕКС ВКЛЮЧАЕТ: 1HHK 81 ЗАМЕЧАНИЕ 4 1.HLA ТЯЖЕЛАЯ ЦЕПЬ идентифицирована как ЦЕПЬ * A * В ЭТОМ ВХОДЕ. 1HHK 82 ЗАМЕЧАНИЕ 4 ЭТА ЦЕПЬ РАЗДЕЛЕНА В ТРИ ДОМЕНА 1HHK 83 ЗАМЕЧАНИЕ 4 АЛЬФА 1 — ОСТАВЛЕНЫ ГЛИ А 1 ЧЕРЕЗ АЛА А 90 1HHK 84 ЗАМЕЧАНИЕ 4 АЛЬФА 2 — ОСТАВЛЕНЫ СЛИШКОМ 91 ЧЕРЕЗ ЭФР РЕЗУЛЬТАТ 2 ЧАСТЬ 2 182 1HH A 183 ЧЕРЕЗ КЛЕЙ A 275 1HHK 86 ЗАМЕЧАНИЕ 4 2. БЕТА-2-МИКРОГЛОБУЛИН, ИДЕНТИФИЦИРОВАННЫЙ КАК ЦЕПЬ * B *. ЭТО 1HHK 88 ЗАМЕЧАНИЕ 4 СЕТЬ СОСТОИТ ИЗ ОСТАТКОВ МЕТ B 0 ЧЕРЕЗ МЕТ B 99.1HHK 89 ЗАМЕЧАНИЕ 4 3. ПЕПТИД НАЛОГА HTLV-1, ОПРЕДЕЛЕННЫЙ КАК ЦЕПЬ * C *. НА ЭТОМ 1HHK 91 ЗАМЕТКА 4 ЦЕПЬ СОСТОИТ ИЗ ОСТАТКОВ LEU C 1 ЧЕРЕЗ VAL C 9. 1HHK 92
Файлы PDB (iii) Последовательность белков: указана для каждой цепочки MET ARG TYR PHE 1HHK 111 SEQRES 2 A 275 PHE THR SER VAL SER ARG PRO GLY ARG GLY GLU PRO ARG 1HHK 112 SEQRES 3 A 275 PHE ILE ALA VAL GLY TYR VAL ASP ASP THR GLN PHE VAL 1HHK 113 Дополнительная информация о конкретных остатках: FTNOTE 1 СТОРОННЯЯ ЦЕПЬ АТОМОВ A 17, A 194, A 196, B 48, B 58, D 17, 1HHK 174 FTNOTE 1 D 194, D 196, E 48 и E 58 РАБОТАЮТ И ИМЕЮТ 1HH 175 FTNOTE 1 ЗАНЯТИЯ Равный нулю в этой записи.1HHK 176 Определение вторичной структуры и дисульфидных связей: HELIX 1 h2 ALA A 49 GLU A 53 1 1HHK 184 HELIX 2 h3 PRO A 57 TYR A 84 1 1HHK 185 … SHEET 1 SA 8 GLU A 46 PRO A 47 0 1HHK 196 ЛИСТ 2 SA 8 THR A 31 ASP A 37 -1 O ARG A 35 N GLU A 46 1HHK 197 …
Файлы PDB (iv) • Структура белка: координаты (координаты используются Deep-View для отображения • структуры на экране): • номер атома • тип атома • тип остатка • имя цепочки • номер остатка • x-координаты • y-координаты • z-координаты • B-фактор • 123456789 • ATOM 1 N GLY A 1 14.851 -6.104 13.115 1.00 30.79 1HHK 273 • ATOM 2 CA GLY A 1 15.736 -5.423 12.197 1.00 28.36 1HHK 274 • ATOM 3 C GLY A 1 15.249 -3.991 12.170 1.00 26.32 1HHK 275 • ATOM 4 O GLY A 1 14.679 1.00 1345,1 26,79 1HHK 276 • ATOM 5 N SER A 2 15,443 -3,339 11,045 1,00 24,58 1HHK 277 • ATOM 6 CA SER A 2 15,070 -1,952 10,856 1,00 22,79 1HHK 278
Технические примечания • Расширения файлов •.Файлы pdb представлены в виде файлов .txt. • При загрузке файлов выберите вкладку «все типы файлов». • Рекомендация • Используйте оглавление! • Следуйте «рукам»
Информация о сайте Адрес веб-сайта упражнений: http://courses.md.huji.ac.il/81817 Адрес веб-сайта лекций (портал EDU): https: //eduportal.ekmd.huji .ac.il / default.aspx (курс № 81817) Путь sPDBv: (с рабочего стола терминала EKMD) Приложения для студентов> Биоинформатика> Веб-сайт упражнений sPDBv открыть 2 окна Программное обеспечение
Как открыть счет EKMD? Откройте этот веб-сайт: http: // agcc.ekmd.huji.ac.il/ekmd.asp • Вам понадобятся • Первые 8 цифр вашего идентификационного номера • Четырехзначный код • Следуйте инструкциям…